RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 DCXO43602 365 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ODC1P11926 461 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MYL4P12829 197 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NFKB1P19838 968 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 IQCF2Q8IXL9 164 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NUF2Q9BZD4 464 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 A6NL46 340 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CYBAP13498 195 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PSMC3P17980 439 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PRDX6P30041 224 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CCR10P46092 362 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 FAM209AQ5JX71 171 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MAPK15Q8TD08 544 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 USP33Q8TEY7 942 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CEP44Q9C0F1 390 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GIN1Q9NXP7 522 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PADI4Q9UM07 663 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 A0A096LPK6 155 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GPR182O15218 404 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ADGRE1Q14246 886 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PHKG1Q16816 387 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 EHD1Q9H4M9 534 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PTPRDP23468 1912 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MTSS1O43312 755 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MGEA5O60502 916 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 POMCP01189 267 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CD52P31358 61 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TAC4Q86UU9 113 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 WDCPQ9H6R7 721 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 COG4Q9H9E3 785 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PATJQ8NI35 1801 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 A0A1W2PPW3 197 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB14O43829 449 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SULT1C4O75897 302 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 F9P00740 461 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MPOP05164 745 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 BDNFP23560 247 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GABRB3P28472 473 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CXCR3P49682 368 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 RAB15P59190 212 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 KCNC4Q03721 635 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 BNIP3Q12983 259 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CRHR2Q13324 411 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 KCNMB4Q86W47 210 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 URGCPQ8TCY9 931 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 EME1Q96AY2 570 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TEKT5Q96M29 485 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 POU2F3Q9UKI9 436 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 KRBA1A5PL33 1030 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 BAIAP3O94812 1187 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 LRIG2O94898 1065 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 HSPA4LO95757 839 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 C2P06681 752 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 EPHA3P29320 983 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 BRCC3P46736 316 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NPY2RP49146 381 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CSRP3P50461 194 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 BMXP51813 675 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 HASPINQ8TF76 798 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PKP2Q99959 881 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CENPOQ9BU64 300 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 PADI3Q9ULW8 664 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 MAGEB16A2A368 324 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 B3GAT3O94766 335 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CHRNGP07510 517 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 INHBBP09529 407 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 THPOP40225 353 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GSSP48637 474 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 FGD3Q5JSP0 725 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TRIB2Q92519 343 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 VAT1Q99536 393 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 IL22Q9GZX6 179 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms