RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TCF12Q99081 682 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CHST7Q9NS84 486 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AP3D1O14617 1153 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PLSCR1O15162 318 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CLDN11O75508 207 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ALOX5P09917 674 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCDC166P0CW27 439 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ASMTP46597 345 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BCAP31P51572 246 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAB25P57735 213 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CAPSQ13938 189 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NDUFA9Q16795 377 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PFKFB4Q16877 469 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 XKR6Q5GH73 641 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PACS1Q6VY07 963 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AMER2Q8N7J2 671 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SNX7Q9UNH6 387 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADM5C9JUS6 153 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR10H2O60403 315 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UNC5CO95185 931 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GPAT3Q53EU6 434 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NACC2Q96BF6 587 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FSCN2O14926 492 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AZIN1O14977 448 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PER2O15055 1255 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MPZL2O60487 215 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DQA2P01906 255 aa7.24□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.24□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CHPFQ8IZ52 775 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PLD4Q96BZ4 506 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EXD2Q9NVH0 621 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COMMD9Q9P000 198 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ABLIM1O14639 778 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DCXO43602 365 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRG2P13727 222 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ITGAXP20702 1163 aa7.24□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 CTNNB1P35222 781 aa7.24□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 FMO1Q01740 532 aa7.24□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 PTP4A2Q12974 167 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CHSY3Q70JA7 882 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OAFQ86UD1 273 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM35AQ86V20 835 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM136AQ96C01 138 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KIFC1Q9BW19 673 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CEP41Q9BYV8 373 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.24□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.24□□□□□ -1.25
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