RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000067837.9

Rnf6-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnf6, Length 2,388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6-201ENSMUST00000067837 NamptQ99KQ4 491 aa11.97□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Lactb2Q99KR3 288 aa11.97□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa11.97□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cpxm2Q9D2L5 764 aa11.97□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Wnt8bQ9WUD6 350 aa11.97□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa11.97□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Itih4A6X935 942 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Rrn3B2RS91 656 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Mup13L7N222 235 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Atn1O35126 1175 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ap3d1O54774 1199 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Nat1P50294 290 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Mtf2Q02395 593 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Oog3Q3UWY1 500 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tmem237Q3V0J1 427 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Znf821Q6PD05 413 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Snx17Q8BVL3 470 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 NcaphQ8C156 731 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Sept8Q8CHH9 429 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tada2aQ8CHV6 443 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Slc45a3Q8K0H7 553 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Batf2Q8R1H8 277 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Olfr397Q8VEZ6 315 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Slc22a7Q91WU2 540 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Unc45aQ99KD5 944 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Dhrs1Q99L04 313 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Polr3eQ9CZT4 710 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Q9D3J9 298 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Spesp1Q9D5A0 399 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Adad2Q9D5P4 478 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 PudpQ9D5U5 234 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Syap1Q9D5V6 365 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 CrotQ9DC50 612 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Il17rbQ9JIP3 499 aa11.96□□□□□ -0.49
Rnf6-201ENSMUST00000067837 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gm7086A0A1W2P766 342 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Vmn1r3A2AMT7 306 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Znf683I7HJS4 458 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Sema3aO08665 772 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Sult2b1O35400 338 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Dmp1O55188 503 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Chrna4O70174 629 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 FynP39688 537 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 InaP46660 501 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gpc4P51655 557 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Plxna1P70206 1894 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Slc22a15Q504N2 544 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Actr3bQ641P0 418 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ip6k1Q6PD10 433 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Far2Q7TNT2 515 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Pcsk9Q80W65 694 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Krt75Q8BGZ7 551 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Elmo2Q8BHL5 732 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cnpy4Q8BQ47 245 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Frs2Q8C180 508 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Vmn1r79Q8R285 306 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gpn2Q8VEJ1 310 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Pard3bQ9CSB4 1203 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Ppil2Q9D787 521 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cngb3Q9JJZ9 694 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Akt3Q9WUA6 479 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Padi4Q9Z183 666 aa11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 PtprfA2A8L5 1898 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tmem131O70472 1877 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gm28363A0A087WQW2 129 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Krt83E9Q1Y9 479 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Serpine3E9Q6A2 401 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Olfr67F8VPJ8 320 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Serpina3kP07759 418 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 JunbP09450 344 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Npr1P18293 1057 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Hspa4lP48722 838 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 1700061G19RikQ08EE8 705 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Cyp4b1Q64462 511 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Tmc7Q8C428 726 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Fem1cQ8CEF1 617 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Zfp65Q91W94 390 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Fam83dQ9D7I8 585 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Eif4e3Q9DBB5 207 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Il23aQ9EQ14 196 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gprc5dQ9JIL6 344 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Nme7Q9QXL8 395 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Disp2Q8CIP5 1345 aa11.95□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa11.94□□□□□ -0.5
Rnf6-201ENSMUST00000067837 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.9 ms