RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vwa1Q8R2Z5 415 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf31Q924T7 1066 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pacsin3Q99JB8 424 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clic3Q9D7P7 237 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spag4Q9JJF2 443 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1023A2ASU6 311 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930402K13RikB1AW18 415 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp946F6VWU8 523 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r5K7N788 911 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm43302L7N1X8 611 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn5O54942 218 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gnao1P18872 354 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vps45P97390 570 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sema3cQ62181 751 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MyorgQ69ZQ1 716 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppm1lQ8BHN0 360 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Peli3Q8BXR6 445 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stk33Q924X7 491 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddit4Q9D3F7 229 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9D4A5 307 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim23Q9DAL0 136 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcab9Q9DAM2 216 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnft1Q9DCN7 395 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Homer2Q9QWW1 354 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NbnQ9R207 751 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Epm2aQ9WUA5 330 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr603L7N1Y4 312 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl7cO08664 217 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hsd17b7O88736 334 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atxn10P28658 475 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sarm1Q6PDS3 724 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clec2eQ80XD9 204 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r213Q8R278 384 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lims2Q91XD2 341 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dctn2Q99KJ8 402 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dhrs1Q99L04 313 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MydgfQ9CPT4 166 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ssxb1Q9CPU1 170 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psmd9Q9CR00 222 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ten1Q9D7K2 161 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Erap1Q9EQH2 930 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PalmdQ9JHU2 551 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GabrqQ9JLF1 638 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lama3Q61789 3330 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Calhm3J3QMI4 347 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BhmtO35490 407 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Btg4O70552 250 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf19aP50636 840 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem165P52875 323 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mc4rP56450 332 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp46P62069 366 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ctps2P70303 586 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scn2bQ56A07 215 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Crhr2Q60748 411 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt32Q62168 407 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abi1Q8CBW3 481 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5591Q8CDK1 855 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acsm2Q8K0L3 575 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Npffr2Q924H0 417 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sntg2Q925E0 539 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhox9Q9EQM5 227 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cacng3Q9JJV5 315 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tuba8Q9JJZ2 449 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Copg1Q9QZE5 874 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl32A2AJX0 620 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3336J3QMQ6 198 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnmt3bO88509 859 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RapsnP12672 412 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hrh2P97292 397 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Yy2Q3TTC2 378 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plcl1Q3USB7 1096 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam181bQ80VF6 417 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbtb24Q80X44 710 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Iars2Q8BIJ6 1012 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clec1aQ8BWY2 269 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdhb17Q91VD8 799 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dennd2dQ91VV4 469 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DdoQ922Z0 341 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Reep3Q99KK1 254 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina1fQ9DCQ7 411 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fgf22Q9ESS2 162 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smpd3Q9JJY3 655 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grm3Q9QYS2 879 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Galk1Q9R0N0 392 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Supt3B0QZW4 406 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp963D3Z2T8 383 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prox1P48437 737 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.1 ms