RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tchhl1Q9D3P1 638 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc7a9Q9QXA6 487 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif9Q9WV04 790 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpm6Q8CIR4 2028 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nlrp1bA1Z198 1177 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d16A2ABG4 766 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh2d4bA6X942 431 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd34aB2RW11 495 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 GmlE9PX31 176 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gp1baO35930 734 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnk2O54967 1055 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp560Q3URI6 754 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 ScinQ60604 715 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde1aQ61481 565 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtprcapQ64697 197 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arl5aQ80ZU0 179 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pacs1Q8K212 961 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hacd3Q8K2C9 362 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atg10Q8R1P4 215 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 DcxrQ91X52 244 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps33Q9D2R8 106 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fzd2Q9JIP6 570 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smad9Q9JIW5 430 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nphs1Q9QZS7 1256 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col4a6B1AVK5 1691 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo10F8VQB6 2062 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm14781A2A9Q9 366 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm13285B1AYI3 182 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm13275B1AYI8 182 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcpp2E9PYC2 171 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcpp1L7N1X9 171 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mllt10O54826 1068 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcf3P15806 651 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc7a2P18581 657 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mageb5Q14AN0 366 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 IfnzQ8BQT1 182 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm13278Q8CD73 182 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fem1cQ8CEF1 617 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 PolbQ8K409 335 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nae1Q8VBW6 534 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aipl1Q924K1 328 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 IqcdQ9D3V1 458 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnbd2Q9D5U8 673 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr63Q9EQQ3 425 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crlf3Q9Z2L7 442 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tp53bp1P70399 1969 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Armt1A6H630 439 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psma3O70435 255 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp8b1O88962 500 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asgr1P34927 284 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dsc1P55849 886 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tax1bp1Q3UKC1 814 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 GkQ64516 559 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr533Q7TRT7 320 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Suds3Q8BR65 328 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp449Q8CB76 518 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sirt5Q8K2C6 310 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xpo6Q924Z6 1125 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kat2bQ9JHD1 813 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacng3Q9JJV5 315 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ror1Q9Z139 937 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kat6aQ8BZ21 2003 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm382B1AXN3 1250 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pou2f3P31362 431 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcd2Q61285 741 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prr18Q6PAN7 307 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ints6Q6PCM2 883 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcas1Q80YN3 633 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sfr1Q8BP27 319 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mat2bQ99LB6 334 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccr10Q9JL21 362 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp952B0V2W4 504 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7275E9Q1B3 247 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aldh1a7O35945 501 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myl2P51667 166 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ldb1P70662 411 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam35aQ3UEN2 891 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 ADGRF3Q58Y75 991 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 CpQ61147 1061 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx31Q6P8Y7 439 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpm4Q7TN37 1213 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Disc1Q811T9 852 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Timm29Q8BGX2 266 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camkk1Q8VBY2 505 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 AslQ91YI0 464 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.9 ms