RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		6	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		6	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	RNF135	Q8IUD6	432 aa		6	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		6	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		6	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L3	A6NCW0	530 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L4	A6NCW7	530 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L5	A8MUK1	530 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	SKI	P12755	728 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC125	Q86Z20	511 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	RNF20	Q5VTR2	975 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	GDF9	O60383	454 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	ADH1C	P00326	375 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	GRM5	P41594	1212 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATRX-223	ENST00000637175	RGS20	O76081	388 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	RFX1	P22670	979 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	NCOA4	Q13772	614 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	FSHR	P23945	695 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PRR20E	P86478	221 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PRR20C	P86479	221 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PRR20D	P86480	221 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PRR20B	P86481	221 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PRR20A	P86496	221 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	NR5A1	Q13285	461 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ATG7	O95352	703 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	NR3C2	P08235	984 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	EML3	Q32P44	896 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ERVK-9	P63128	1117 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	FOXC1	Q12948	553 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ARID5B	Q14865	1188 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	FAM196B	A6NMK8	535 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	RETREG2	Q8NC44	543 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	NOD1	Q9Y239	953 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L15	C9J2P7	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L10	C9JJH3	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L12	C9JPN9	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L11	C9JVI0	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L21	D6R901	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L18	D6R9N7	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L22	D6RA61	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L19	D6RCP7	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L20	D6RJB6	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	LILRA1	O75019	489 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	DKK1	O94907	266 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ALDH1A1	P00352	501 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	SCTR	P47872	440 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	RAB15	P59190	212 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	CLDN10	P78369	228 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	USP17L24	Q0WX57	530 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PTK7	Q13308	1070 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	NNT	Q13423	1086 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	CDCA8	Q53HL2	280 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM50	Q86XT4	487 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		5.91	□□□□□ -1.46

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