RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636228.1

CLN3-246, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN3, Length 1,224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-246ENST00000636228 NBPF14Q5TI25 921 aa22.98■■□□□ 1.27
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CLN3-246ENST00000636228 NME9Q86XW9 330 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-246ENST00000636228 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-246ENST00000636228 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-246ENST00000636228 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN3-246ENST00000636228 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-246ENST00000636228 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.96■■□□□ 1.27
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CLN3-246ENST00000636228 NBPF4Q96M43 638 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN3-246ENST00000636228 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CLN3-246ENST00000636228 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CLN3-246ENST00000636228 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN3-246ENST00000636228 SYT17Q9BSW7 474 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN3-246ENST00000636228 BTAF1O14981 1849 aa22.56■■□□□ 1.2
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CLN3-246ENST00000636228 MYOM1P52179 1685 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN3-246ENST00000636228 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN3-246ENST00000636228 AKT1S1Q96B36 256 aa22.55■■□□□ 1.2
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