RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628044.1

PFKL-212, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PFKL, Length 129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-212ENST00000628044 APBA3O96018 575 aa28.98■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.96■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.96■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 DDB1Q16531 1140 aa28.95■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 NME9Q86XW9 330 aa28.95■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 USP31Q70CQ4 1352 aa28.95■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.95■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 NFAT5O94916 1531 aa28.94■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.93■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 A0A1W2PP64 1363 aa28.92■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.92■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.92■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 TESK2Q96S53 571 aa28.92■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 COL18A1P39060 1754 aa28.92■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.91■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.91■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.91■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.91■■■□□ 2.22
PFKL-212ENST00000628044 ABCC6O95255 1503 aa28.89■■■□□ 2.21
PFKL-212ENST00000628044 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PFKL-212ENST00000628044 CCDC7Q96M83 1385 aa28.86■■■□□ 2.21
PFKL-212ENST00000628044 USP47Q96K76 1375 aa28.85■■■□□ 2.21
PFKL-212ENST00000628044 LRRC37A3O60309 1634 aa28.84■■■□□ 2.21
PFKL-212ENST00000628044 TMF1P82094 1093 aa28.83■■■□□ 2.21
PFKL-212ENST00000628044 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.82■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 USP54Q70EL1 1684 aa28.82■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 ERBB3P21860 1342 aa28.81■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 EXOC5O00471 708 aa28.81■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 NBPF14Q5TI25 921 aa28.8■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.8■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 COG3Q96JB2 828 aa28.79■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.79■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.78■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 RGPD5Q99666 1765 aa28.78■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 LRP5O75197 1615 aa28.77■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 CDCA8Q53HL2 280 aa28.77■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.76■■■□□ 2.2
PFKL-212ENST00000628044 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.76■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 PEAK1Q9H792 1746 aa28.76■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.75■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 BCL9O00512 1426 aa28.74■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 TNS2Q63HR2 1409 aa28.72■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 PLSCR1O15162 318 aa28.72■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 IL2RBP14784 551 aa28.72■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 IP6K1Q92551 441 aa28.72■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 LTN1O94822 1766 aa28.72■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 RREB1Q92766 1687 aa28.7■■■□□ 2.19
PFKL-212ENST00000628044 AMPHP49418 695 aa28.68■■■□□ 2.18
PFKL-212ENST00000628044 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PFKL-212ENST00000628044 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.67■■■□□ 2.18
PFKL-212ENST00000628044 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.66■■■□□ 2.18
PFKL-212ENST00000628044 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.66■■■□□ 2.18
PFKL-212ENST00000628044 FYB1O15117 783 aa28.63■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 HOXC9P31274 260 aa28.63■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.63■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 SBF2Q86WG5 1849 aa28.62■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.62■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 FBLN1P23142 703 aa28.6■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.59■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 RTL1A6NKG5 1358 aa28.59■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 KCNQ2O43526 872 aa28.58■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
PFKL-212ENST00000628044 TXNRD1Q16881 649 aa28.56■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 PROM2Q8N271 834 aa28.55■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 SPON1Q9HCB6 807 aa28.55■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 STK32BQ9NY57 414 aa28.52■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.52■■■□□ 2.16
PFKL-212ENST00000628044 NHSQ6T4R5 1651 aa28.51■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.5■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.5■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 FLT4P35916 1363 aa28.47■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.47■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.46■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.46■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 NBPF4Q96M43 638 aa28.46■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 INSRP06213 1382 aa28.46■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.45■■■□□ 2.15
PFKL-212ENST00000628044 SLC15A2Q16348 729 aa28.45■■■□□ 2.14
PFKL-212ENST00000628044 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.45■■■□□ 2.14
PFKL-212ENST00000628044 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
PFKL-212ENST00000628044 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.45■■■□□ 2.14
PFKL-212ENST00000628044 MYOM1P52179 1685 aa28.45■■■□□ 2.14
PFKL-212ENST00000628044 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms