RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	CRB1	P82279	1406 aa		40.6	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP31	Q70CQ4	1352 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDCA8	Q53HL2	280 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SEMA3B-215	ENST00000621029	NFAT5	O94916	1531 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SEMA3B-215	ENST00000621029	BAG6	P46379	1132 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL18A1	P39060	1754 aa		40.5	■■■■■ 4.07
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRIM37	O94972	964 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	COG3	Q96JB2	828 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDB1	Q16531	1140 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP54	Q70EL1	1684 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGPD5	Q99666	1765 aa		40.38	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		40.37	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABCC6	O95255	1503 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	APBA3	O96018	575 aa		40.33	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		40.33	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		40.32	■■■■■ 4.05
SEMA3B-215	ENST00000621029	ERBB3	P21860	1342 aa		40.31	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC7	Q96M83	1385 aa		40.31	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	40.3	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		40.3	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	LTN1	O94822	1766 aa		40.29	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	FYB1	O15117	783 aa		40.27	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		40.26	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	EXOC5	O00471	708 aa		40.26	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	AMPH	P49418	695 aa		40.26	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	IP6K1	Q92551	441 aa		40.26	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	FBLN1	P23142	703 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.24	■■■■■ 4.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		40.23	■■■■■ 4.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	40.2	■■■■■ 4.03
SEMA3B-215	ENST00000621029	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		40.19	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	40.18	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		40.18	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		40.18	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	HOXC9	P31274	260 aa		40.17	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		40.16	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	IL2RB	P14784	551 aa		40.16	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
SEMA3B-215	ENST00000621029	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		40.12	■■■■■ 4.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYOM1	P52179	1685 aa		40.12	■■■■■ 4.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.1	■■■■■ 4.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNS2	Q63HR2	1409 aa		40.09	■■■■■ 4.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	40.08	■■■■■ 4.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
SEMA3B-215	ENST00000621029	RTL1	A6NKG5	1358 aa		40.07	■■■■■ 4
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		40.06	■■■■■ 4
SEMA3B-215	ENST00000621029	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		40.05	■■■■■ 4
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		40.04	■■■■■ 4
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBPF14	Q5TI25	921 aa		40.01	■■■■■ 4
SEMA3B-215	ENST00000621029	BCL9	O00512	1426 aa		40	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		39.98	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		39.97	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLSCR1	O15162	318 aa		39.96	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		39.96	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	SBF2	Q86WG5	1849 aa		39.95	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	FLT4	P35916	1363 aa		39.95	■■■■□ 3.99
SEMA3B-215	ENST00000621029	PANK3	Q9H999	370 aa		39.94	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		39.94	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNQ2	O43526	872 aa		39.93	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		39.93	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBPF4	Q96M43	638 aa		39.93	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		39.92	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	INSR	P06213	1382 aa		39.92	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		39.9	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	RREB1	Q92766	1687 aa		39.89	■■■■□ 3.98
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	39.88	■■■■□ 3.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		39.87	■■■■□ 3.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	39.86	■■■■□ 3.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		39.85	■■■■□ 3.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		39.84	■■■■□ 3.97
SEMA3B-215	ENST00000621029	MEGF6	O75095	1541 aa		39.81	■■■■□ 3.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	39.81	■■■■□ 3.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	TXNRD1	Q16881	649 aa		39.8	■■■■□ 3.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	PROM2	Q8N271	834 aa		39.79	■■■■□ 3.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	39.79	■■■■□ 3.96
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		39.79	■■■■□ 3.96

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms