RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa40.61■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 AXIN2Q9Y2T1 843 aa40.61■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 CRB1P82279 1406 aa40.6■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 USP31Q70CQ4 1352 aa40.59■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa40.58■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR17Q8IZU2 1322 aa40.53■■■■■ 4.08
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SEMA3B-215ENST00000621029 BAG6P46379 1132 aa40.52■■■■■ 4.08
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM196AQ6ZSG2 479 aa40.52■■■■■ 4.08
SEMA3B-215ENST00000621029 COL18A1P39060 1754 aa40.5■■■■■ 4.07
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SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM37O94972 964 aa40.44■■■■■ 4.06
SEMA3B-215ENST00000621029 COG3Q96JB2 828 aa40.44■■■■■ 4.06
SEMA3B-215ENST00000621029 CARD10Q9BWT7 1032 aa40.41■■■■■ 4.06
SEMA3B-215ENST00000621029 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
SEMA3B-215ENST00000621029 DDB1Q16531 1140 aa40.4■■■■■ 4.06
SEMA3B-215ENST00000621029 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa40.4■■■■■ 4.06
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SEMA3B-215ENST00000621029 USP54Q70EL1 1684 aa40.4■■■■■ 4.06
SEMA3B-215ENST00000621029 RGPD5Q99666 1765 aa40.38■■■■■ 4.05
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SEMA3B-215ENST00000621029 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
SEMA3B-215ENST00000621029 NLRP2Q9NX02 1062 aa40.36■■■■■ 4.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCC6O95255 1503 aa40.36■■■■■ 4.05
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SEMA3B-215ENST00000621029 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.33■■■■■ 4.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD24Q8TF21 1146 aa40.32■■■■■ 4.05
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SEMA3B-215ENST00000621029 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 GGNBP2Q9H3C7 697 aa40.3■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 LTN1O94822 1766 aa40.29■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 FYB1O15117 783 aa40.27■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa40.26■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 EXOC5O00471 708 aa40.26■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 AMPHP49418 695 aa40.26■■■■■ 4.04
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SEMA3B-215ENST00000621029 IP6K1Q92551 441 aa40.26■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC37A3O60309 1634 aa40.25■■■■■ 4.03
SEMA3B-215ENST00000621029 FBLN1P23142 703 aa40.25■■■■■ 4.03
SEMA3B-215ENST00000621029 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
SEMA3B-215ENST00000621029 DISP2A7MBM2 1401 aa40.24■■■■■ 4.03
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP3K19Q56UN5 1328 aa40.23■■■■■ 4.03
SEMA3B-215ENST00000621029 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SEMA3B-215ENST00000621029 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
SEMA3B-215ENST00000621029 CAMKK2Q96RR4 588 aa40.19■■■■■ 4.02
SEMA3B-215ENST00000621029 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
SEMA3B-215ENST00000621029 CARD14Q9BXL6 1004 aa40.18■■■■■ 4.02
SEMA3B-215ENST00000621029 WNK3Q9BYP7 1800 aa40.18■■■■■ 4.02
SEMA3B-215ENST00000621029 HOXC9P31274 260 aa40.17■■■■■ 4.02
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SEMA3B-215ENST00000621029 IL2RBP14784 551 aa40.16■■■■■ 4.02
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SEMA3B-215ENST00000621029 TNS2Q63HR2 1409 aa40.09■■■■■ 4.01
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SEMA3B-215ENST00000621029 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.06■■■■■ 4
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SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF14Q5TI25 921 aa40.01■■■■■ 4
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL9O00512 1426 aa40■■■■□ 3.99
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SEMA3B-215ENST00000621029 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 ACSBG1Q96GR2 724 aa39.97■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 PLSCR1O15162 318 aa39.96■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa39.96■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 SBF2Q86WG5 1849 aa39.95■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 FLT4P35916 1363 aa39.95■■■■□ 3.99
SEMA3B-215ENST00000621029 PANK3Q9H999 370 aa39.94■■■■□ 3.98
SEMA3B-215ENST00000621029 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa39.94■■■■□ 3.98
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNQ2O43526 872 aa39.93■■■■□ 3.98
SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF6Q5VWK0 638 aa39.93■■■■□ 3.98
SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF4Q96M43 638 aa39.93■■■■□ 3.98
SEMA3B-215ENST00000621029 USHBP1Q8N6Y0 703 aa39.92■■■■□ 3.98
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SEMA3B-215ENST00000621029 KIF24Q5T7B8 1368 aa39.9■■■■□ 3.98
SEMA3B-215ENST00000621029 RREB1Q92766 1687 aa39.89■■■■□ 3.98
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
SEMA3B-215ENST00000621029 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.85■■■■□ 3.97
SEMA3B-215ENST00000621029 RGPD2P0DJD1 1756 aa39.84■■■■□ 3.97
SEMA3B-215ENST00000621029 MEGF6O75095 1541 aa39.81■■■■□ 3.96
SEMA3B-215ENST00000621029 TATP17735 454 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
SEMA3B-215ENST00000621029 TXNRD1Q16881 649 aa39.8■■■■□ 3.96
SEMA3B-215ENST00000621029 PROM2Q8N271 834 aa39.79■■■■□ 3.96
SEMA3B-215ENST00000621029 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
SEMA3B-215ENST00000621029 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa39.79■■■■□ 3.96
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