RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 AMPHP49418 695 aa28.15■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 CHRNA2Q15822 529 aa28.15■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 ABCC6O95255 1503 aa28.14■■■□□ 2.1
CSAG3-202ENST00000617158 LRP6O75581 1613 aa28.14■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.13■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 FAM83GA6ND36 823 aa28.12■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 IL13P35225 146 aa28.12■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.12■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 CFAP53Q96M91 514 aa28.11■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.11■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.09■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.09■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.08■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTS2O95450 1211 aa28.06■■■□□ 2.08
CSAG3-202ENST00000617158 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.05■■■□□ 2.08
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.02■■■□□ 2.08
CSAG3-202ENST00000617158 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.02■■■□□ 2.08
CSAG3-202ENST00000617158 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CSAG3-202ENST00000617158 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.01■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 NRAPQ86VF7 1730 aa28.01■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 ERBB3P21860 1342 aa28■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 EYA1Q99502 592 aa28■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 SLIT2O94813 1529 aa27.98■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.98■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 NCAPD2Q15021 1401 aa27.98■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.97■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF4Q96M43 638 aa27.97■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.97■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 BTG4Q9NY30 223 aa27.96■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 NUDCQ9Y266 331 aa27.96■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CSAG3-202ENST00000617158 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.95■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.92■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 KDRP35968 1356 aa27.92■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.92■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.92■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.91■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 HMOX1P09601 288 aa27.91■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.9■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 C8orf37Q96NL8 207 aa27.9■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.9■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 STRN4Q9NRL3 753 aa27.89■■■□□ 2.06
CSAG3-202ENST00000617158 FCHSD2O94868 740 aa27.87■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.87■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 NGLY1Q96IV0 654 aa27.87■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.86■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.86■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 CRB1P82279 1406 aa27.84■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 PRKAR2BP31323 418 aa27.84■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 EVA1CP58658 441 aa27.84■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.83■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.83■■■□□ 2.05
CSAG3-202ENST00000617158 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.81■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.81■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.81■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 RUNDC1Q96C34 613 aa27.81■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 AFF2P51816 1311 aa27.81■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 MEGF6O75095 1541 aa27.79■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 USP21Q9UK80 565 aa27.78■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.78■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.77■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.77■■■□□ 2.04
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.76■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 DISP2A7MBM2 1401 aa27.75■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 APAF1O14727 1248 aa27.75■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 VPS72Q15906 364 aa27.75■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.75■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 ATRNO75882 1429 aa27.74■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.73■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.72■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 USP35Q9P2H5 1018 aa27.72■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 GLI3P10071 1580 aa27.72■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.7■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.7■■■□□ 2.03
CSAG3-202ENST00000617158 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
CSAG3-202ENST00000617158 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms