RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, human

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FMR1-216	ENST00000616614	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		43.68	■■■■■ 4.58
FMR1-216	ENST00000616614	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	43.67	■■■■■ 4.58
FMR1-216	ENST00000616614	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	43.66	■■■■■ 4.58
FMR1-216	ENST00000616614	EVA1C	P58658	441 aa		43.65	■■■■■ 4.58
FMR1-216	ENST00000616614	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	43.65	■■■■■ 4.58
FMR1-216	ENST00000616614	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	43.65	■■■■■ 4.58
FMR1-216	ENST00000616614	GLI3	P10071	1580 aa		43.63	■■■■■ 4.58
FMR1-216	ENST00000616614	NSD2	O96028	1365 aa		43.62	■■■■■ 4.57
FMR1-216	ENST00000616614	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		43.62	■■■■■ 4.57
FMR1-216	ENST00000616614	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		43.62	■■■■■ 4.57
FMR1-216	ENST00000616614	LTN1	O94822	1766 aa		43.59	■■■■■ 4.57
FMR1-216	ENST00000616614	IP6K1	Q92551	441 aa		43.58	■■■■■ 4.57
FMR1-216	ENST00000616614	ABCC6	O95255	1503 aa		43.58	■■■■■ 4.57
FMR1-216	ENST00000616614	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	43.57	■■■■■ 4.57
FMR1-216	ENST00000616614	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		43.56	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	HOXC9	P31274	260 aa		43.56	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	RGS12	O14924	1447 aa		43.55	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	AMPH	P49418	695 aa		43.54	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	MORC1	Q86VD1	984 aa		43.54	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		43.54	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	43.54	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		43.54	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	43.53	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	RGPD5	Q99666	1765 aa		43.52	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		43.52	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	USP35	Q9P2H5	1018 aa		43.51	■■■■■ 4.56
FMR1-216	ENST00000616614	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	POLK	Q9UBT6	870 aa		43.49	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	ERBB3	P21860	1342 aa		43.49	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	43.48	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		43.48	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	CRB1	P82279	1406 aa		43.48	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	PEAK1	Q9H792	1746 aa		43.47	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	43.47	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		43.47	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	RTL1	A6NKG5	1358 aa		43.47	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		43.47	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		43.46	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		43.45	■■■■■ 4.55
FMR1-216	ENST00000616614	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	43.44	■■■■■ 4.54
FMR1-216	ENST00000616614	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		43.42	■■■■■ 4.54
FMR1-216	ENST00000616614	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	43.41	■■■■■ 4.54
FMR1-216	ENST00000616614	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		43.41	■■■■■ 4.54
FMR1-216	ENST00000616614	FLT4	P35916	1363 aa		43.41	■■■■■ 4.54
FMR1-216	ENST00000616614	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		43.41	■■■■■ 4.54
FMR1-216	ENST00000616614	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		43.39	■■■■■ 4.54
FMR1-216	ENST00000616614	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		43.38	■■■■■ 4.53
FMR1-216	ENST00000616614	INSR	P06213	1382 aa		43.37	■■■■■ 4.53
FMR1-216	ENST00000616614	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	43.36	■■■■■ 4.53
FMR1-216	ENST00000616614	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		43.36	■■■■■ 4.53
FMR1-216	ENST00000616614	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	43.36	■■■■■ 4.53
FMR1-216	ENST00000616614	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	43.33	■■■■■ 4.53
FMR1-216	ENST00000616614	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.53
FMR1-216	ENST00000616614		A0A0G2JS52	829 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FMR1-216	ENST00000616614	MYT1	Q01538	1121 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FMR1-216	ENST00000616614	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		43.3	■■■■■ 4.52
FMR1-216	ENST00000616614	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		43.26	■■■■■ 4.52
FMR1-216	ENST00000616614	NBPF4	Q96M43	638 aa		43.26	■■■■■ 4.52
FMR1-216	ENST00000616614	MTHFS	P49914	203 aa		43.22	■■■■■ 4.51
FMR1-216	ENST00000616614	DISP2	A7MBM2	1401 aa		43.21	■■■■■ 4.51
FMR1-216	ENST00000616614	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	43.2	■■■■■ 4.51
FMR1-216	ENST00000616614	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		43.19	■■■■■ 4.5
FMR1-216	ENST00000616614	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		43.19	■■■■■ 4.5
FMR1-216	ENST00000616614	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		43.19	■■■■■ 4.5
FMR1-216	ENST00000616614	SOCS7	O14512	581 aa		43.17	■■■■■ 4.5
FMR1-216	ENST00000616614	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
FMR1-216	ENST00000616614	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		43.16	■■■■■ 4.5
FMR1-216	ENST00000616614	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
FMR1-216	ENST00000616614	FAM182B	Q5T319	152 aa		43.13	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	EYA1	Q99502	592 aa		43.13	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	IL2RB	P14784	551 aa		43.12	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		43.11	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	PPP2R1A	P30153	589 aa		43.11	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		43.09	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	DDB1	Q16531	1140 aa		43.09	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	LRRC37A3	O60309	1634 aa		43.07	■■■■■ 4.49
FMR1-216	ENST00000616614	IL13	P35225	146 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FMR1-216	ENST00000616614	PDE3B	Q13370	1112 aa		43.05	■■■■■ 4.48
FMR1-216	ENST00000616614	NCAPD2	Q15021	1401 aa		43.05	■■■■■ 4.48
FMR1-216	ENST00000616614	EP400	Q96L91	3159 aa		43.05	■■■■■ 4.48
FMR1-216	ENST00000616614	MEGF6	O75095	1541 aa		43.03	■■■■■ 4.48
FMR1-216	ENST00000616614	EXOC5	O00471	708 aa		43.02	■■■■■ 4.48
FMR1-216	ENST00000616614	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	43.01	■■■■■ 4.48
FMR1-216	ENST00000616614	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		43	■■■■■ 4.47
FMR1-216	ENST00000616614	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
FMR1-216	ENST00000616614	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
FMR1-216	ENST00000616614	TNS2	Q63HR2	1409 aa		42.98	■■■■■ 4.47
FMR1-216	ENST00000616614	RALBP1	Q15311	655 aa		42.96	■■■■■ 4.47
FMR1-216	ENST00000616614	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		42.96	■■■■■ 4.47
FMR1-216	ENST00000616614	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
FMR1-216	ENST00000616614	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FMR1-216	ENST00000616614	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
FMR1-216	ENST00000616614	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		42.91	■■■■■ 4.46
FMR1-216	ENST00000616614	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FMR1-216	ENST00000616614	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FMR1-216	ENST00000616614	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
FMR1-216	ENST00000616614	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45

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