RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
STX4-217ENST00000613541 BCL9O00512 1426 aa24.66■■□□□ 1.54
STX4-217ENST00000613541 EVC2Q86UK5 1308 aa24.64■■□□□ 1.54
STX4-217ENST00000613541 LRRC37A3O60309 1634 aa24.64■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.62■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.62■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 STK32BQ9NY57 414 aa24.62■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 EXOC5O00471 708 aa24.61■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.61■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.6■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.6■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 COL18A1P39060 1754 aa24.59■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.59■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 AKAP12Q02952 1782 aa24.58■■□□□ 1.53
STX4-217ENST00000613541 CASZ1Q86V15 1759 aa24.57■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 PROM2Q8N271 834 aa24.57■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.57■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.56■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 CCDC7Q96M83 1385 aa24.56■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 ZBTB7AO95365 584 aa24.56■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 TXNRD1Q16881 649 aa24.56■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 PIK3C2AO00443 1686 aa24.56■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 SLC15A2Q16348 729 aa24.55■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.55■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.53■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 PTGER2P43116 358 aa24.52■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 MTFR1LQ9H019 292 aa24.52■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
STX4-217ENST00000613541 ABCC6O95255 1503 aa24.51■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 SOX12O15370 315 aa24.5■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 RGPD5Q99666 1765 aa24.49■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 SYT17Q9BSW7 474 aa24.48■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 TNS2Q63HR2 1409 aa24.47■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.46■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 MYOM1P52179 1685 aa24.46■■□□□ 1.51
STX4-217ENST00000613541 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.43■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 NFAT5O94916 1531 aa24.43■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.42■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 IL2RBP14784 551 aa24.42■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 ARXQ96QS3 562 aa24.42■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 CHD4Q14839 1912 aa24.41■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 USP31Q70CQ4 1352 aa24.41■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 NHSQ6T4R5 1651 aa24.4■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.4■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.4■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 ERBB3P21860 1342 aa24.39■■□□□ 1.5
STX4-217ENST00000613541 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 MAP3K5Q99683 1374 aa24.38■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.36■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.34■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.34■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.34■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.33■■□□□ 1.49
STX4-217ENST00000613541 POLD1P28340 1107 aa24.32■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 GPR162Q16538 588 aa24.32■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 USP54Q70EL1 1684 aa24.31■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 NME9Q86XW9 330 aa24.31■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 TMC1Q8TDI8 760 aa24.31■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 BTAF1O14981 1849 aa24.31■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.3■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 PAPPAQ13219 1627 aa24.3■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 LTN1O94822 1766 aa24.29■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 C1QTNF8P60827 252 aa24.28■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 NEUROD1Q13562 356 aa24.28■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 ZNF827Q17R98 1081 aa24.28■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.28■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.27■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.27■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
STX4-217ENST00000613541 AKT1S1Q96B36 256 aa24.26■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 IP6K1Q92551 441 aa24.25■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.24■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.24■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 KLHL34Q8N239 644 aa24.23■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.23■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.22■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.22■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
STX4-217ENST00000613541 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.18■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.18■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 GRIN3BO60391 1043 aa24.17■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 SLC24A1O60721 1099 aa24.17■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
STX4-217ENST00000613541 COG3Q96JB2 828 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms