RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 RTL1A6NKG5 1358 aa27.13■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.13■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.13■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.13■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 HOXC9P31274 260 aa27.12■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.12■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 USP21Q9UK80 565 aa27.12■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.12■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 FLT4P35916 1363 aa27.09■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 EVA1CP58658 441 aa27.09■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 PEAK1Q9H792 1746 aa27.09■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 NRAPQ86VF7 1730 aa27.08■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
FCHO1-232ENST00000600209 PPP2R1AP30153 589 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 MTHFSP49914 203 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 INSRP06213 1382 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.05■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 STRN4Q9NRL3 753 aa27.04■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 VPS72Q15906 364 aa27.03■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.03■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 ERBB3P21860 1342 aa27.02■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.02■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 ANP32CO43423 234 aa27.02■■□□□ 1.92
FCHO1-232ENST00000600209 ATRNO75882 1429 aa27■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 CRB1P82279 1406 aa26.98■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.97■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.96■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.96■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 CFAP53Q96M91 514 aa26.96■■□□□ 1.91
FCHO1-232ENST00000600209 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.95■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.94■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 POTEAQ6S8J7 498 aa26.94■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.94■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.93■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 IL13P35225 146 aa26.91■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 RXRBP28702 533 aa26.9■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.9■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.9■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 NBPF4Q96M43 638 aa26.9■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
FCHO1-232ENST00000600209 GLI3P10071 1580 aa26.88■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 BARGINQ6ZT62 677 aa26.88■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 EYA1Q99502 592 aa26.88■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 USP35Q9P2H5 1018 aa26.88■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 NUDCQ9Y266 331 aa26.85■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 NCAPD2Q15021 1401 aa26.83■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
FCHO1-232ENST00000600209 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.81■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.8■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 IL2RBP14784 551 aa26.79■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 DISP2A7MBM2 1401 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-232ENST00000600209 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.76■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 KDRP35968 1356 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC184Q52MB2 194 aa26.73■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 A0A0G2JS52 829 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 EXOC5O00471 708 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 MYT1Q01538 1121 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 FCHSD2O94868 740 aa26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 HMOX1P09601 288 aa26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 MRS2Q9HD23 443 aa26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.7■■□□□ 1.87
FCHO1-232ENST00000600209 CCER2I3L3R5 266 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms