RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599794.5

TIMM50-213, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TIMM50, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-213ENST00000599794 USP54Q70EL1 1684 aa28.42■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 TMF1P82094 1093 aa28.41■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 CRB1P82279 1406 aa28.41■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 RGPD5Q99666 1765 aa28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 SLC24A1O60721 1099 aa28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.39■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.39■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TIMM50-213ENST00000599794 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM50-213ENST00000599794 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM50-213ENST00000599794 FBLN1P23142 703 aa28.37■■■□□ 2.13
TIMM50-213ENST00000599794 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM50-213ENST00000599794 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.35■■■□□ 2.13
TIMM50-213ENST00000599794 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.32■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 PDE3BQ13370 1112 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 FYB1O15117 783 aa28.3■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.3■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 TRIM37O94972 964 aa28.29■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 DISP2A7MBM2 1401 aa28.26■■■□□ 2.12
TIMM50-213ENST00000599794 ERBB3P21860 1342 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 ABCC6O95255 1503 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 LTN1O94822 1766 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.25■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 MYOM1P52179 1685 aa28.24■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 CDCA8Q53HL2 280 aa28.24■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 COG3Q96JB2 828 aa28.24■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 BAG6P46379 1132 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 IP6K1Q92551 441 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 LRRC37A3O60309 1634 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 DDB1Q16531 1140 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 PEAK1Q9H792 1746 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TIMM50-213ENST00000599794 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.19■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 APBA3O96018 575 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 CCDC7Q96M83 1385 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 HOXC9P31274 260 aa28.16■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.15■■■□□ 2.1
TIMM50-213ENST00000599794 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.13■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 EXOC5O00471 708 aa28.12■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.11■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 AMPHP49418 695 aa28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 SBF2Q86WG5 1849 aa28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 IL2RBP14784 551 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 BCL9O00512 1426 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM50-213ENST00000599794 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 TNS2Q63HR2 1409 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 KCNQ2O43526 872 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 NBPF4Q96M43 638 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 PROM2Q8N271 834 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 PANK3Q9H999 370 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 RTL1A6NKG5 1358 aa28.02■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TIMM50-213ENST00000599794 PARD3Q8TEW0 1356 aa28■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 RREB1Q92766 1687 aa28■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 PLSCR1O15162 318 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 INSRP06213 1382 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.98■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.98■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.97■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 MEGF6O75095 1541 aa27.96■■■□□ 2.07
TIMM50-213ENST00000599794 POLKQ9UBT6 870 aa27.95■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 FLT4P35916 1363 aa27.94■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.92■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
TIMM50-213ENST00000599794 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.89■■■□□ 2.05
TIMM50-213ENST00000599794 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TIMM50-213ENST00000599794 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.88■■■□□ 2.05
TIMM50-213ENST00000599794 NHSQ6T4R5 1651 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms