RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599594.1

NUMBL-208, Transcript of NUMB like, endocytic adaptor protein, human

TSL 5

Gene NUMBL, Length 393 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMBL-208	ENST00000599594	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.22	■■■□□ 2.91
NUMBL-208	ENST00000599594	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
NUMBL-208	ENST00000599594	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
NUMBL-208	ENST00000599594	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
NUMBL-208	ENST00000599594	ATRN	O75882	1429 aa		33.19	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.17	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.16	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	AMPH	P49418	695 aa		33.16	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.15	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	EVA1C	P58658	441 aa		33.15	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	IP6K1	Q92551	441 aa		33.14	■■■□□ 2.9
NUMBL-208	ENST00000599594	VPS72	Q15906	364 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	HOXC9	P31274	260 aa		33.12	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	GLI3	P10071	1580 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	FLT4	P35916	1363 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
NUMBL-208	ENST00000599594	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	RXRB	P28702	533 aa		33.06	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.06	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	ERBB3	P21860	1342 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	CRB1	P82279	1406 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	INSR	P06213	1382 aa		33.03	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NUMBL-208	ENST00000599594	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33	■■■□□ 2.87
NUMBL-208	ENST00000599594	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
NUMBL-208	ENST00000599594	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.99	■■■□□ 2.87
NUMBL-208	ENST00000599594	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.98	■■■□□ 2.87
NUMBL-208	ENST00000599594	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.96	■■■□□ 2.87
NUMBL-208	ENST00000599594	MTHFS	P49914	203 aa		32.95	■■■□□ 2.87
NUMBL-208	ENST00000599594	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.95	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		32.94	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.94	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	RGS12	O14924	1447 aa		32.93	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.92	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	RALBP1	Q15311	655 aa		32.9	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.9	■■■□□ 2.86
NUMBL-208	ENST00000599594	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.88	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594		A0A0G2JS52	829 aa		32.87	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	MYT1	Q01538	1121 aa		32.87	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.86	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.86	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.86	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.85	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.85	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
NUMBL-208	ENST00000599594	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.82	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.81	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	EYA1	Q99502	592 aa		32.8	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.79	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.79	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.79	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	IL13	P35225	146 aa		32.78	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.77	■■■□□ 2.84
NUMBL-208	ENST00000599594	IL2RB	P14784	551 aa		32.76	■■■□□ 2.83
NUMBL-208	ENST00000599594	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.75	■■■□□ 2.83
NUMBL-208	ENST00000599594	MEGF6	O75095	1541 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NUMBL-208	ENST00000599594	ANP32C	O43423	234 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NUMBL-208	ENST00000599594	DDB1	Q16531	1140 aa		32.7	■■■□□ 2.83
NUMBL-208	ENST00000599594	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.7	■■■□□ 2.83
NUMBL-208	ENST00000599594	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.68	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.67	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.67	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	EXOC5	O00471	708 aa		32.66	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.65	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.65	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.64	■■■□□ 2.82
NUMBL-208	ENST00000599594	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.63	■■■□□ 2.81

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