RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.8■□□□□ 0.6
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CTIF-210ENST00000591412 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CTIF-210ENST00000591412 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-210ENST00000591412 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-210ENST00000591412 NME9Q86XW9 330 aa18.79■□□□□ 0.6
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CTIF-210ENST00000591412 USP54Q70EL1 1684 aa18.79■□□□□ 0.6
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CTIF-210ENST00000591412 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.57■□□□□ 0.56
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CTIF-210ENST00000591412 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-210ENST00000591412 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CTIF-210ENST00000591412 RTL1A6NKG5 1358 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-210ENST00000591412 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CTIF-210ENST00000591412 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
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CTIF-210ENST00000591412 SPON1Q9HCB6 807 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-210ENST00000591412 FLT4P35916 1363 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-210ENST00000591412 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CTIF-210ENST00000591412 CASZ1Q86V15 1759 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-210ENST00000591412 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CTIF-210ENST00000591412 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CTIF-210ENST00000591412 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.542e-12■■■■■ 51.9
CTIF-210ENST00000591412 SLC15A2Q16348 729 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-210ENST00000591412 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.44■□□□□ 0.54
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