RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 BARGINQ6ZT62 677 aa28.13■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.13■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.12■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 USP35Q9P2H5 1018 aa28.11■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 CRB1P82279 1406 aa28.1■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 ABCC6O95255 1503 aa28.1■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.1■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 COG3Q96JB2 828 aa28.1■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 A0A0G2JS52 829 aa28.09■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 MYT1Q01538 1121 aa28.09■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.08■■■□□ 2.09
UBXN6-206ENST00000590466 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.06■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.05■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 RGPD5Q99666 1765 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 FBLN1P23142 703 aa28.03■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 EP400Q96L91 3159 aa28.03■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC125Q86Z20 511 aa28.02■■■□□ 2.08
UBXN6-206ENST00000590466 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.01■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 LTN1O94822 1766 aa28.01■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 IP6K1Q92551 441 aa28■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 ERBB3P21860 1342 aa27.99■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.98■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 FAM182BQ5T319 152 aa27.98■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 PANK3Q9H999 370 aa27.96■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.95■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.95■■■□□ 2.07
UBXN6-206ENST00000590466 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.95■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.94■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 HOXC9P31274 260 aa27.94■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC7Q96M83 1385 aa27.93■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 DISP2A7MBM2 1401 aa27.92■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 PDE3BQ13370 1112 aa27.92■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 AMPHP49418 695 aa27.91■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 RTL1A6NKG5 1358 aa27.9■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.9■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.89■■■□□ 2.06
UBXN6-206ENST00000590466 DDB1Q16531 1140 aa27.87■■■□□ 2.05
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC37A3O60309 1634 aa27.86■■■□□ 2.05
UBXN6-206ENST00000590466 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.86■■■□□ 2.05
UBXN6-206ENST00000590466 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
UBXN6-206ENST00000590466 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.85■■■□□ 2.05
UBXN6-206ENST00000590466 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
UBXN6-206ENST00000590466 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.84■■■□□ 2.05
UBXN6-206ENST00000590466 PEAK1Q9H792 1746 aa27.82■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.82■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.82■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 INSRP06213 1382 aa27.82■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.81■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 FLT4P35916 1363 aa27.81■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM37O94972 964 aa27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 IL2RBP14784 551 aa27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 NSD2O96028 1365 aa27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 EXOC5O00471 708 aa27.79■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.78■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 POLKQ9UBT6 870 aa27.78■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 TNS2Q63HR2 1409 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 NBPF4Q96M43 638 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 BCL9O00512 1426 aa27.76■■■□□ 2.04
UBXN6-206ENST00000590466 BAG6P46379 1132 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.71■■■□□ 2.03
UBXN6-206ENST00000590466 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 MORC1Q86VD1 984 aa27.7■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 APBA3O96018 575 aa27.69■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.69■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.68■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.67■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 MEGF6O75095 1541 aa27.67■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 NCAPD2Q15021 1401 aa27.66■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 SBF2Q86WG5 1849 aa27.65■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
UBXN6-206ENST00000590466 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.62■■■□□ 2.01
UBXN6-206ENST00000590466 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
UBXN6-206ENST00000590466 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
UBXN6-206ENST00000590466 EYA1Q99502 592 aa27.62■■■□□ 2.01
UBXN6-206ENST00000590466 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.61■■■□□ 2.01
UBXN6-206ENST00000590466 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
UBXN6-206ENST00000590466 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms