RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 IRF5Q13568 498 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 PNMA3Q9UL41 463 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF3BO15066 747 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNC4Q03721 635 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 AGLP35573 1532 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 WWC1Q8IX03 1113 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 A2MP01023 1474 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP4CP60510 307 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 CERKQ8TCT0 537 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 PADI6Q6TGC4 694 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC13Q8NBP0 860 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 REREQ9P2R6 1566 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP7AQ04656 1500 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 ZMYM3Q14202 1370 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF26B4DH59 902 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 MADDQ8WXG6 1647 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCA6Q8N139 1617 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 SOCS7O14512 581 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNA1Q09470 495 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCC5O15440 1437 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-216ENST00000590105 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 E9PSI1 815 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 APLP1P51693 650 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF516Q92618 1163 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 MTRQ99707 1265 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF40O75150 1001 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 BRD1O95696 1058 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 HSPA2P54652 639 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRKQ9NRH2 765 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 RFC5P40937 340 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 DAPK1P53355 1430 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 EYA1Q99502 592 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 USTQ9Y2C2 406 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGAEP38570 1179 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 NCOA1Q15788 1441 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-216ENST00000590105 PLXNC1O60486 1568 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF15Q9NS87 1388 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 PHOX2BQ99453 314 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IGSF3O75054 1194 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 OATP04181 439 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM161AQ3B820 660 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 NPATQ14207 1427 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPRKQ15262 1439 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IL21Q9HBE4 155 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms