RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 PIK3C2AO00443 1686 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 RGPD5Q99666 1765 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 COL18A1P39060 1754 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 EVC2Q86UK5 1308 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 SOX12O15370 315 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 CASZ1Q86V15 1759 aa21.89■■□□□ 1.1
ACTN4-211ENST00000589528 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 EXOC5O00471 708 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZBTB7AO95365 584 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 STK32BQ9NY57 414 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 BCL9O00512 1426 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 MYOM1P52179 1685 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-211ENST00000589528 TXNRD1Q16881 649 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 PROM2Q8N271 834 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC7Q96M83 1385 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 SLC15A2Q16348 729 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 NFAT5O94916 1531 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 ABCC6O95255 1503 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 TNS2Q63HR2 1409 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 NHSQ6T4R5 1651 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTN4-211ENST00000589528 CHD4Q14839 1912 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 PTGER2P43116 358 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 MTFR1LQ9H019 292 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 LTN1O94822 1766 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 NEUROD1Q13562 356 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 UTRNP46939 3433 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 BTAF1O14981 1849 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 SYT17Q9BSW7 474 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 IL2RBP14784 551 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 ERBB3P21860 1342 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 TMC1Q8TDI8 760 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 USP54Q70EL1 1684 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 NME9Q86XW9 330 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 USP31Q70CQ4 1352 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 ARXQ96QS3 562 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 PAPPAQ13219 1627 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTN4-211ENST00000589528 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 KLHL34Q8N239 644 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 GPR162Q16538 588 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF827Q17R98 1081 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 POLD1P28340 1107 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 MAP3K5Q99683 1374 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTN4-211ENST00000589528 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 A0A1W2PP64 1363 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 IP6K1Q92551 441 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 AKT1S1Q96B36 256 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 C1QTNF8P60827 252 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 COG3Q96JB2 828 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTN4-211ENST00000589528 AMPHP49418 695 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTN4-211ENST00000589528 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTN4-211ENST00000589528 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTN4-211ENST00000589528 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms