RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587989.1

TMUB2-209, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-209ENST00000587989 NBR1Q14596 966 aa21.64■■□□□ 1.05
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TMUB2-209ENST00000587989 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
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TMUB2-209ENST00000587989 RALBP1Q15311 655 aa21.63■■□□□ 1.05
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TMUB2-209ENST00000587989 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.53■■□□□ 1.04
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TMUB2-209ENST00000587989 COL18A1P39060 1754 aa21.51■■□□□ 1.03
TMUB2-209ENST00000587989 IL27Q8NEV9 243 aa21.5■■□□□ 1.03
TMUB2-209ENST00000587989 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.5■■□□□ 1.03
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TMUB2-209ENST00000587989 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.46■■□□□ 1.03
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TMUB2-209ENST00000587989 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.42■■□□□ 1.02
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TMUB2-209ENST00000587989 IL13P35225 146 aa21.4■■□□□ 1.02
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TMUB2-209ENST00000587989 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.36■■□□□ 1.01
TMUB2-209ENST00000587989 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.36■■□□□ 1.01
TMUB2-209ENST00000587989 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.35■■□□□ 1.01
TMUB2-209ENST00000587989 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.34■■□□□ 1.01
TMUB2-209ENST00000587989 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.34■■□□□ 1.01
TMUB2-209ENST00000587989 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TMUB2-209ENST00000587989 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TMUB2-209ENST00000587989 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.34■■□□□ 1.01
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