RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAF4-216ENST00000586813 NFAT5O94916 1531 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAF4-216ENST00000586813 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAF4-216ENST00000586813 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAF4-216ENST00000586813 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAF4-216ENST00000586813 USP54Q70EL1 1684 aa27.65■■■□□ 2.02
TRAF4-216ENST00000586813 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.64■■■□□ 2.02
TRAF4-216ENST00000586813 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.64■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 ABCC6O95255 1503 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 SOX12O15370 315 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 DDB1Q16531 1140 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 LTN1O94822 1766 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAF4-216ENST00000586813 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.57■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.57■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF14Q5TI25 921 aa27.54■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 USP31Q70CQ4 1352 aa27.53■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.53■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.53■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 BCL9O00512 1426 aa27.52■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 TONSLQ96HA7 1378 aa27.52■■■□□ 2
TRAF4-216ENST00000586813 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC7Q96M83 1385 aa27.49■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 PLSCR1O15162 318 aa27.48■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 NME9Q86XW9 330 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 TMC1Q8TDI8 760 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 TNS2Q63HR2 1409 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAF4-216ENST00000586813 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 CASZ1Q86V15 1759 aa27.45■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 A0A1W2PP64 1363 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 ERBB3P21860 1342 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 NHSQ6T4R5 1651 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 EXOC5O00471 708 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TRAF4-216ENST00000586813 SPON1Q9HCB6 807 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 PROM2Q8N271 834 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 KCNQ2O43526 872 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 TESK2Q96S53 571 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.34■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 BTAF1O14981 1849 aa27.34■■□□□ 1.97
TRAF4-216ENST00000586813 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 IL2RBP14784 551 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 TXNRD1Q16881 649 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 PAPPAQ13219 1627 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 MYOM1P52179 1685 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAF4-216ENST00000586813 SLC24A1O60721 1099 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 IP6K1Q92551 441 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 STK32BQ9NY57 414 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 COG3Q96JB2 828 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 SLC15A2Q16348 729 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB7AO95365 584 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 USP47Q96K76 1375 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAF4-216ENST00000586813 HOXC9P31274 260 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 PTGER2P43116 358 aa27.17■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 FBLN1P23142 703 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 AMPHP49418 695 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 RTL1A6NKG5 1358 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 TMF1P82094 1093 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TRAF4-216ENST00000586813 MEGF6O75095 1541 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 MTFR1LQ9H019 292 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 YY1P25490 414 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 LY75O60449 1722 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 FYB1O15117 783 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF827Q17R98 1081 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAF4-216ENST00000586813 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms