RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586773.5

CIRBP-211, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-211ENST00000586773 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.59■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 NFAT5O94916 1531 aa28.59■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.57■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 CRB1P82279 1406 aa28.57■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.56■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.56■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 COL18A1P39060 1754 aa28.55■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.55■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.55■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.55■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 ABCC6O95255 1503 aa28.54■■■□□ 2.16
CIRBP-211ENST00000586773 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.54■■■□□ 2.16
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CIRBP-211ENST00000586773 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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CIRBP-211ENST00000586773 MYOM1P52179 1685 aa28.5■■■□□ 2.15
CIRBP-211ENST00000586773 PDE3BQ13370 1112 aa28.49■■■□□ 2.15
CIRBP-211ENST00000586773 LTN1O94822 1766 aa28.48■■■□□ 2.15
CIRBP-211ENST00000586773 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.48■■■□□ 2.15
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CIRBP-211ENST00000586773 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.46■■■□□ 2.15
CIRBP-211ENST00000586773 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.46■■■□□ 2.15
CIRBP-211ENST00000586773 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.44■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 AMPHP49418 695 aa28.43■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 IP6K1Q92551 441 aa28.43■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.43■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.43■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 CCDC7Q96M83 1385 aa28.42■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.42■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 ERBB3P21860 1342 aa28.42■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.41■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.4■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.4■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 DDB1Q16531 1140 aa28.39■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 FAM182BQ5T319 152 aa28.39■■■□□ 2.14
CIRBP-211ENST00000586773 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
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CIRBP-211ENST00000586773 HOXC9P31274 260 aa28.35■■■□□ 2.13
CIRBP-211ENST00000586773 RTL1A6NKG5 1358 aa28.35■■■□□ 2.13
CIRBP-211ENST00000586773 FBLN1P23142 703 aa28.34■■■□□ 2.13
CIRBP-211ENST00000586773 BAG6P46379 1132 aa28.34■■■□□ 2.13
CIRBP-211ENST00000586773 EXOC5O00471 708 aa28.33■■■□□ 2.13
CIRBP-211ENST00000586773 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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CIRBP-211ENST00000586773 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.31■■■□□ 2.12
CIRBP-211ENST00000586773 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.31■■■□□ 2.12
CIRBP-211ENST00000586773 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.31■■■□□ 2.12
CIRBP-211ENST00000586773 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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CIRBP-211ENST00000586773 EP400Q96L91 3159 aa28.29■■■□□ 2.12
CIRBP-211ENST00000586773 LRRC37A3O60309 1634 aa28.29■■■□□ 2.12
CIRBP-211ENST00000586773 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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CIRBP-211ENST00000586773 FLT4P35916 1363 aa28.26■■■□□ 2.12
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CIRBP-211ENST00000586773 INSRP06213 1382 aa28.24■■■□□ 2.11
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CIRBP-211ENST00000586773 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.21■■■□□ 2.11
CIRBP-211ENST00000586773 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CIRBP-211ENST00000586773 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.21■■■□□ 2.11
CIRBP-211ENST00000586773 TNS2Q63HR2 1409 aa28.2■■■□□ 2.11
CIRBP-211ENST00000586773 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.2■■■□□ 2.1
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CIRBP-211ENST00000586773 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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CIRBP-211ENST00000586773 BCL9O00512 1426 aa28.17■■■□□ 2.1
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CIRBP-211ENST00000586773 NBPF4Q96M43 638 aa28.16■■■□□ 2.1
CIRBP-211ENST00000586773 POLKQ9UBT6 870 aa28.16■■■□□ 2.1
CIRBP-211ENST00000586773 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.16■■■□□ 2.1
CIRBP-211ENST00000586773 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.14■■■□□ 2.1
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CIRBP-211ENST00000586773 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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CIRBP-211ENST00000586773 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CIRBP-211ENST00000586773 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CIRBP-211ENST00000586773 SBF2Q86WG5 1849 aa28.09■■■□□ 2.09
CIRBP-211ENST00000586773 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CIRBP-211ENST00000586773 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.09■■■□□ 2.09
CIRBP-211ENST00000586773 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CIRBP-211ENST00000586773 PLSCR1O15162 318 aa28.06■■■□□ 2.08
CIRBP-211ENST00000586773 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CIRBP-211ENST00000586773 MEGF6O75095 1541 aa28.03■■■□□ 2.08
CIRBP-211ENST00000586773 NBPF14Q5TI25 921 aa28.02■■■□□ 2.08
CIRBP-211ENST00000586773 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.02■■■□□ 2.08
CIRBP-211ENST00000586773 EYA1Q99502 592 aa28.01■■■□□ 2.07
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