RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585692.5

MFSD11-204, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 11, human

TSL 5

Gene MFSD11, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD11-204	ENST00000585692	ESPN	B1AK53	854 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD11-204	ENST00000585692	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MFSD11-204	ENST00000585692	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD11-204	ENST00000585692	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	SKI	P12755	728 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	WNT7A	O00755	349 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	RFX1	P22670	979 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	MPND	Q8N594	471 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	SIAH2	O43255	324 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MFSD11-204	ENST00000585692	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	NCOA4	Q13772	614 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	ADH1C	P00326	375 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	FSHR	P23945	695 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	GRM5	P41594	1212 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	EML3	Q32P44	896 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	ATG7	O95352	703 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	RAB15	P59190	212 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	FOXC1	Q12948	553 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	NR5A1	Q13285	461 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	CDCA8	Q53HL2	280 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD11-204	ENST00000585692	GDF9	O60383	454 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L15	C9J2P7	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L10	C9JJH3	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L12	C9JPN9	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L11	C9JVI0	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L21	D6R901	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L18	D6R9N7	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L22	D6RA61	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L19	D6RCP7	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L20	D6RJB6	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	NR3C2	P08235	984 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP17L24	Q0WX57	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	RGS20	O76081	388 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	SCTR	P47872	440 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	CLDN10	P78369	228 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	USP4	Q13107	963 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	PTK7	Q13308	1070 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	UST	Q9Y2C2	406 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	RASA1	P20936	1047 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	ATP1A2	P50993	1020 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	GTF2I	P78347	998 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	PRR20E	P86478	221 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	PRR20C	P86479	221 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MFSD11-204	ENST00000585692	PRR20D	P86480	221 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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