RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CDK19Q9BWU1 502 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINC1P01008 464 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 SIL1Q9H173 461 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC184Q52MB2 194 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 MPNDQ8N594 471 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 CABP1Q9NZU7 370 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 JMYQ8N9B5 988 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 ME1P48163 572 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 MYO6Q9UM54 1294 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 KRT85P78386 507 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 SYNJ2O15056 1496 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF428Q96B54 188 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 PLCD4Q9BRC7 762 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 WDR97A6NE52 1622 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.647e-8■■■■■ 186.3
PTPRM-211ENST00000580170 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-211ENST00000580170 MCM4P33991 863 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 DACH1Q9UI36 760 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 AACSQ86V21 672 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 ESPNB1AK53 854 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 TAF3Q5VWG9 929 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC69A6NI79 296 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA32Q96LK8 384 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 GRIN2BQ13224 1484 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 MYL6BP14649 208 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 SLFN5Q08AF3 891 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 SYNJ1O43426 1573 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CABP4P57796 275 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 SRGAP3O43295 1099 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 CBFA2T2O43439 604 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0754O94854 1291 aa25.2■■□□□ 1.63
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 SYCP1Q15431 976 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 TIAM1Q13009 1591 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 DAPK1P53355 1430 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 STIM1Q13586 685 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 STRN4Q9NRL3 753 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 ERICH4A6NGS2 130 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 DEF6Q9H4E7 631 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP45Q9UL16 551 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 HECW1Q76N89 1606 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 USP8P40818 1118 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL34Q8N239 644 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 FCHSD2O94868 740 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC181Q5TID7 509 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.14■■□□□ 1.62
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