RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 MYOM1P52179 1685 aa16.11■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.11■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 CRB1P82279 1406 aa16.11■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.09■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 COL18A1P39060 1754 aa16.08■□□□□ 0.17
GGA3-204ENST00000578208 BARGINQ6ZT62 677 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 LTN1O94822 1766 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 CCDC125Q86Z20 511 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 FYB1O15117 783 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 PDE3BQ13370 1112 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 RGPD5Q99666 1765 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 AMPHP49418 695 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 CCDC7Q96M83 1385 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 ERBB3P21860 1342 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-204ENST00000578208 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 IP6K1Q92551 441 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 RTL1A6NKG5 1358 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 WNK3Q9BYP7 1800 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 DDB1Q16531 1140 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 LRRC37A3O60309 1634 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 HOXC9P31274 260 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 FAM182BQ5T319 152 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 PANK3Q9H999 370 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 FBLN1P23142 703 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 BAG6P46379 1132 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.96■□□□□ 0.15
GGA3-204ENST00000578208 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 DISP2A7MBM2 1401 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 NSD2O96028 1365 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 FLT4P35916 1363 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 EXOC5O00471 708 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 TNS2Q63HR2 1409 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 EP400Q96L91 3159 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 IL2RBP14784 551 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 TRIM37O94972 964 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 INSRP06213 1382 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 PEAK1Q9H792 1746 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-204ENST00000578208 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 MORC1Q86VD1 984 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 APBA3O96018 575 aa15.88■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.88■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 BCL9O00512 1426 aa15.85■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.85■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.85■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 NBPF4Q96M43 638 aa15.85■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 POLKQ9UBT6 870 aa15.85■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.85■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.84■□□□□ 0.13
GGA3-204ENST00000578208 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 MEGF6O75095 1541 aa15.83■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 SBF2Q86WG5 1849 aa15.82■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 NHSQ6T4R5 1651 aa15.8■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.8■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.79■□□□□ 0.12
GGA3-204ENST00000578208 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms