RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573990.1

SPNS2-207, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 761 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-207ENST00000573990 BARGINQ6ZT62 677 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 EP400Q96L91 3159 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 RGPD5Q99666 1765 aa27.16■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 CRB1P82279 1406 aa27.16■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 USP54Q70EL1 1684 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 CDCA8Q53HL2 280 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS2-207ENST00000573990 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS2-207ENST00000573990 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SPNS2-207ENST00000573990 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
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SPNS2-207ENST00000573990 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS2-207ENST00000573990 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS2-207ENST00000573990 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS2-207ENST00000573990 FBLN1P23142 703 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS2-207ENST00000573990 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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SPNS2-207ENST00000573990 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS2-207ENST00000573990 FYB1O15117 783 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 LTN1O94822 1766 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 MYOM1P52179 1685 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 TRIM37O94972 964 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS2-207ENST00000573990 ABCC6O95255 1503 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.01■■□□□ 1.91
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SPNS2-207ENST00000573990 ERBB3P21860 1342 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 IP6K1Q92551 441 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 DDB1Q16531 1140 aa26.98■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.98■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 BAG6P46379 1132 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 LRRC37A3O60309 1634 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS2-207ENST00000573990 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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SPNS2-207ENST00000573990 DISP2A7MBM2 1401 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS2-207ENST00000573990 CCDC7Q96M83 1385 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS2-207ENST00000573990 HOXC9P31274 260 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS2-207ENST00000573990 AMPHP49418 695 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS2-207ENST00000573990 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SPNS2-207ENST00000573990 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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SPNS2-207ENST00000573990 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS2-207ENST00000573990 EXOC5O00471 708 aa26.91■■□□□ 1.9
SPNS2-207ENST00000573990 APBA3O96018 575 aa26.91■■□□□ 1.9
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SPNS2-207ENST00000573990 PANK3Q9H999 370 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS2-207ENST00000573990 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.88■■□□□ 1.89
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SPNS2-207ENST00000573990 IL2RBP14784 551 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS2-207ENST00000573990 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS2-207ENST00000573990 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS2-207ENST00000573990 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS2-207ENST00000573990 RTL1A6NKG5 1358 aa26.83■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 TNS2Q63HR2 1409 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 SBF2Q86WG5 1849 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 NBPF4Q96M43 638 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
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SPNS2-207ENST00000573990 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SPNS2-207ENST00000573990 INSRP06213 1382 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 FLT4P35916 1363 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 KCNQ2O43526 872 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 BCL9O00512 1426 aa26.75■■□□□ 1.87
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SPNS2-207ENST00000573990 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 POLKQ9UBT6 870 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.72■■□□□ 1.87
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SPNS2-207ENST00000573990 MEGF6O75095 1541 aa26.71■■□□□ 1.87
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SPNS2-207ENST00000573990 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.7■■□□□ 1.87
SPNS2-207ENST00000573990 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS2-207ENST00000573990 RREB1Q92766 1687 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS2-207ENST00000573990 PLSCR1O15162 318 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS2-207ENST00000573990 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SPNS2-207ENST00000573990 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS2-207ENST00000573990 PROM2Q8N271 834 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS2-207ENST00000573990 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.67■■□□□ 1.86
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