RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 NFAT5O94916 1531 aa16.06■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.06■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCC6O95255 1503 aa16.05■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.05■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 NBPF14Q5TI25 921 aa16.05■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.04■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 USP54Q70EL1 1684 aa16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 DDB1Q16531 1140 aa16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.02■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.02■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
KIAA0556-208ENST00000568622 CASZ1Q86V15 1759 aa16.02■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 USP31Q70CQ4 1352 aa16.01■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 PROM2Q8N271 834 aa16.01■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.01■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.01■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 KCNQ2O43526 872 aa16■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 SPON1Q9HCB6 807 aa16■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 RGPD5Q99666 1765 aa16■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC7Q96M83 1385 aa15.99■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.99■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.98■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 TNS2Q63HR2 1409 aa15.98■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
KIAA0556-208ENST00000568622 ERBB3P21860 1342 aa15.94■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 NHSQ6T4R5 1651 aa15.93■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 EXOC5O00471 708 aa15.93■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 SOX12O15370 315 aa15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 PTGER2P43116 358 aa15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 TXNRD1Q16881 649 aa15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 PAPPAQ13219 1627 aa15.92■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.91■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 YY1P25490 414 aa15.91■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 NEUROD1Q13562 356 aa15.91■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 NME9Q86XW9 330 aa15.9■□□□□ 0.14
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC15A2Q16348 729 aa15.89■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.89■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 LTN1O94822 1766 aa15.89■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 MYOM1P52179 1685 aa15.89■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.88■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 A0A1W2PP64 1363 aa15.87■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 IL2RBP14784 551 aa15.87■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.87■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 ZBTB7AO95365 584 aa15.86■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 STK32BQ9NY57 414 aa15.86■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.85■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 TESK2Q96S53 571 aa15.84■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 MTFR1LQ9H019 292 aa15.84■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.84■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 BTAF1O14981 1849 aa15.84■□□□□ 0.13
KIAA0556-208ENST00000568622 IP6K1Q92551 441 aa15.83■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.83■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TMC1Q8TDI8 760 aa15.82■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.82■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MAP3K5Q99683 1374 aa15.82■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 SYT17Q9BSW7 474 aa15.81■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.81■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.79■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF827Q17R98 1081 aa15.79■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 AKT1S1Q96B36 256 aa15.79■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.79■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TONSLQ96HA7 1378 aa15.78■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.77■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 NSD2O96028 1365 aa15.77■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.77■□□□□ 0.12
KIAA0556-208ENST00000568622 UTRNP46939 3433 aa15.77■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.76■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 HOXC9P31274 260 aa15.76■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.76■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.75■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 ARXQ96QS3 562 aa15.75■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 RTL1A6NKG5 1358 aa15.75■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 MEGF6O75095 1541 aa15.74■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC24A1O60721 1099 aa15.74■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.74■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 LY75O60449 1722 aa15.74■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.73■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 COG3Q96JB2 828 aa15.73■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.73■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 FBLN1P23142 703 aa15.72■□□□□ 0.11
KIAA0556-208ENST00000568622 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms