RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567432.1

GINS3-208, Transcript of GINS complex subunit 3, human

TSL 3

Gene GINS3, Length 322 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GINS3-208	ENST00000567432	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	ATP9B	O43861	1147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	GDF9	O60383	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	GRM5	P41594	1212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	ADH1C	P00326	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	SKI	P12755	728 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	NR5A1	Q13285	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TNFRSF10A	O00220	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	FSHR	P23945	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	RAB15	P59190	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PRR20E	P86478	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PRR20C	P86479	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PRR20D	P86480	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PRR20B	P86481	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PRR20A	P86496	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432		J3QL48	77 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	RFX1	P22670	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	TRIM52	Q96A61	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	NR3C2	P08235	984 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	SMPD1	P17405	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	USP4	Q13107	963 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	NNT	Q13423	1086 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	NCOA4	Q13772	614 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	EML3	Q32P44	896 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	MYT1	Q01538	1121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	CYLD	Q9NQC7	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	LILRA1	O75019	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	RASA1	P20936	1047 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	SCTR	P47872	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GINS3-208	ENST00000567432	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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