RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 EVA1CP58658 441 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 MORC1Q86VD1 984 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 LTN1O94822 1766 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 ILDR2Q71H61 639 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 IP6K1Q92551 441 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC6O95255 1503 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.45■■□□□ 1.51
SPNS1-208ENST00000566059 AMPHP49418 695 aa24.45■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 HOXC9P31274 260 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 RGPD5Q99666 1765 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 POLKQ9UBT6 870 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 GLI3P10071 1580 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 RTL1A6NKG5 1358 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 ERBB3P21860 1342 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-208ENST00000566059 PEAK1Q9H792 1746 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 USP35Q9P2H5 1018 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 CRB1P82279 1406 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 FLT4P35916 1363 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 RGS12O14924 1447 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 INSRP06213 1382 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-208ENST00000566059 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 BARGINQ6ZT62 677 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 MTHFSP49914 203 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 A0A0G2JS52 829 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 MYT1Q01538 1121 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF4Q96M43 638 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-208ENST00000566059 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 PPP2R1AP30153 589 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 DISP2A7MBM2 1401 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 EP400Q96L91 3159 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 EYA1Q99502 592 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-208ENST00000566059 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 IL2RBP14784 551 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 RALBP1Q15311 655 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 IL13P35225 146 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 NCAPD2Q15021 1401 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 DDB1Q16531 1140 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 PDE3BQ13370 1112 aa24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-208ENST00000566059 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 EXOC5O00471 708 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 FAM182BQ5T319 152 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 MEGF6O75095 1541 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC37A3O60309 1634 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP53Q96M91 514 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 TNS2Q63HR2 1409 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 SOCS7O14512 581 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-208ENST00000566059 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.08■■□□□ 1.45
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