RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-212ENST00000561293 USP35Q9P2H5 1018 aa28.79■■■□□ 2.2
MEIS3-212ENST00000561293 SLIT2O94813 1529 aa28.78■■■□□ 2.2
MEIS3-212ENST00000561293 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-212ENST00000561293 MTHFSP49914 203 aa28.77■■■□□ 2.2
MEIS3-212ENST00000561293 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
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MEIS3-212ENST00000561293 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 EVA1CP58658 441 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 IP6K1Q92551 441 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 COL18A1P39060 1754 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 PPP2R1AP30153 589 aa28.75■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 POTEAQ6S8J7 498 aa28.74■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.73■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.73■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
MEIS3-212ENST00000561293 FLT4P35916 1363 aa28.7■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 ERBB3P21860 1342 aa28.69■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.69■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.68■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 NRAPQ86VF7 1730 aa28.67■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.67■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 RTL1A6NKG5 1358 aa28.64■■■□□ 2.18
MEIS3-212ENST00000561293 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.64■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 RALBP1Q15311 655 aa28.63■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 INSRP06213 1382 aa28.63■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 ANP32CO43423 234 aa28.63■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.63■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF4Q96M43 638 aa28.63■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.62■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 VPS72Q15906 364 aa28.62■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC184Q52MB2 194 aa28.62■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 ATRNO75882 1429 aa28.62■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
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MEIS3-212ENST00000561293 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.59■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.59■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.59■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.58■■■□□ 2.17
MEIS3-212ENST00000561293 A0A0G2JS52 829 aa28.57■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 MYT1Q01538 1121 aa28.57■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 CRB1P82279 1406 aa28.57■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 EYA1Q99502 592 aa28.57■■■□□ 2.16
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MEIS3-212ENST00000561293 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.55■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.55■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC6O95255 1503 aa28.55■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 RXRBP28702 533 aa28.53■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 EP400Q96L91 3159 aa28.53■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 HMOX1P09601 288 aa28.52■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.52■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.51■■■□□ 2.16
MEIS3-212ENST00000561293 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
MEIS3-212ENST00000561293 CFAP53Q96M91 514 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-212ENST00000561293 MIER1Q8N108 512 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-212ENST00000561293 FAM182BQ5T319 152 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-212ENST00000561293 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-212ENST00000561293 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.45■■■□□ 2.15
MEIS3-212ENST00000561293 RGS12O14924 1447 aa28.45■■■□□ 2.14
MEIS3-212ENST00000561293 MEGF6O75095 1541 aa28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-212ENST00000561293 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-212ENST00000561293 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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MEIS3-212ENST00000561293 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-212ENST00000561293 ILDR2Q71H61 639 aa28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-212ENST00000561293 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.41■■■□□ 2.14
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MEIS3-212ENST00000561293 MRS2Q9HD23 443 aa28.41■■■□□ 2.14
MEIS3-212ENST00000561293 BARGINQ6ZT62 677 aa28.39■■■□□ 2.14
MEIS3-212ENST00000561293 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 DISP2A7MBM2 1401 aa28.37■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.37■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.37■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 NUDCQ9Y266 331 aa28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 DDB1Q16531 1140 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 NCAPD2Q15021 1401 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-212ENST00000561293 PRKAR2BP31323 418 aa28.33■■■□□ 2.13
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