RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-216ENST00000560243 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.28■□□□□ 0.2
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RABGGTA-216ENST00000560243 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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RABGGTA-216ENST00000560243 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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RABGGTA-216ENST00000560243 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.01■□□□□ 0.15
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RABGGTA-216ENST00000560243 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-216ENST00000560243 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-216ENST00000560243 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-216ENST00000560243 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-216ENST00000560243 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-216ENST00000560243 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-216ENST00000560243 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-216ENST00000560243 NHSQ6T4R5 1651 aa15.98■□□□□ 0.15
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