RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 VPS72Q15906 364 aa25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 NSD2O96028 1365 aa25.95■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.95■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 RGS12O14924 1447 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 STRN4Q9NRL3 753 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 EVA1CP58658 441 aa25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 PEAK1Q9H792 1746 aa25.89■■□□□ 1.74
RABGGTA-208ENST00000558954 RTL1A6NKG5 1358 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 CRB1P82279 1406 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.85■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.85■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.84■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.84■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-208ENST00000558954 AMPHP49418 695 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 FBLN1P23142 703 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 IP6K1Q92551 441 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 ERBB3P21860 1342 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 FLT4P35916 1363 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXC9P31274 260 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 USP35Q9P2H5 1018 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 MORC1Q86VD1 984 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC37A3O60309 1634 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0G2JS52 829 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 MYT1Q01538 1121 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 BARGINQ6ZT62 677 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 INSRP06213 1382 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-208ENST00000558954 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 POLKQ9UBT6 870 aa25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 DISP2A7MBM2 1401 aa25.67■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 EP400Q96L91 3159 aa25.66■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.64■■□□□ 1.7
RABGGTA-208ENST00000558954 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 TNS2Q63HR2 1409 aa25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 SBF2Q86WG5 1849 aa25.6■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.58■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 NCAPD2Q15021 1401 aa25.58■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 IL2RBP14784 551 aa25.58■■□□□ 1.69
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE3BQ13370 1112 aa25.57■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 DDB1Q16531 1140 aa25.57■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF4Q96M43 638 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 MEGF6O75095 1541 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 MTHFSP49914 203 aa25.55■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-208ENST00000558954 EXOC5O00471 708 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM182BQ5T319 152 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 EYA1Q99502 592 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP2R1AP30153 589 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 NHSQ6T4R5 1651 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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