RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEAK1Q9H792 1746 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOXC9P31274 260 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCA3Q99758 1704 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 IP6K1Q92551 441 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPDO75976 1380 aa22.83■■□□□ 1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL13P35225 146 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RUNDC1Q96C34 613 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA0232Q92628 1395 aa22.8■■□□□ 1.24
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USP3-AS1-201ENST00000558831 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 JCADQ9P266 1359 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 APAF1O14727 1248 aa22.78■■□□□ 1.24
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USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC6O95255 1503 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPA1LP34931 641 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HMOX1P09601 288 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHRNA2Q15822 529 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FCHSD2O94868 740 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEFMP07197 916 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL18A1P39060 1754 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEUROD2Q15784 382 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRKAR2BP31323 418 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGPD5Q99666 1765 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERBB3P21860 1342 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM83GA6ND36 823 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 NGEFQ8N5V2 710 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 EYA1Q99502 592 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS2O95450 1211 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDE3BQ13370 1112 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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USP3-AS1-201ENST00000558831 EVA1CP58658 441 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBPF4Q96M43 638 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDRP35968 1356 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTG4Q9NY30 223 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXO41Q8TF61 875 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 RIPK4P57078 832 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA2Q08379 1002 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 WWC1Q8IX03 1113 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRN4Q9NRL3 753 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF521Q96K83 1311 aa22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC27Q2M243 656 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFE2L2Q16236 605 aa22.58■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCAPD2Q15021 1401 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRP6O75581 1613 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8orf37Q96NL8 207 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NGLY1Q96IV0 654 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR63Q8IWG1 891 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRB1P82279 1406 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLIT2O94813 1529 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLFN5Q08AF3 891 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 E9PSI1 815 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRAPQ86VF7 1730 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.5■■□□□ 1.19
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