RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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TSPAN3-204ENST00000558394 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.81■■□□□ 1.72
TSPAN3-204ENST00000558394 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.81■■□□□ 1.72
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TSPAN3-204ENST00000558394 CABP1Q9NZU7 370 aa25.81■■□□□ 1.72
TSPAN3-204ENST00000558394 SLIT3O75094 1523 aa25.81■■□□□ 1.72
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TSPAN3-204ENST00000558394 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.8■■□□□ 1.72
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TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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TSPAN3-204ENST00000558394 PTGER2P43116 358 aa25.77■■□□□ 1.72
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TSPAN3-204ENST00000558394 COL18A1P39060 1754 aa25.76■■□□□ 1.71
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TSPAN3-204ENST00000558394 SYT17Q9BSW7 474 aa25.75■■□□□ 1.71
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TSPAN3-204ENST00000558394 TNS2Q63HR2 1409 aa25.64■■□□□ 1.7
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TSPAN3-204ENST00000558394 C1QTNF8P60827 252 aa25.62■■□□□ 1.69
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TSPAN3-204ENST00000558394 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.62■■□□□ 1.69
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TSPAN3-204ENST00000558394 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.47■■□□□ 1.67
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TSPAN3-204ENST00000558394 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN3-204ENST00000558394 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN3-204ENST00000558394 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.45■■□□□ 1.66
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TSPAN3-204ENST00000558394 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.43■■□□□ 1.66
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TSPAN3-204ENST00000558394 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSPAN3-204ENST00000558394 USP54Q70EL1 1684 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPAN3-204ENST00000558394 TMC1Q8TDI8 760 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPAN3-204ENST00000558394 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.39■■□□□ 1.66
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TSPAN3-204ENST00000558394 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.35■■□□□ 1.65
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TSPAN3-204ENST00000558394 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.34■■□□□ 1.65
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TSPAN3-204ENST00000558394 KCNQ4P56696 695 aa25.34■■□□□ 1.65
TSPAN3-204ENST00000558394 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.34■■□□□ 1.65
TSPAN3-204ENST00000558394 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TSPAN3-204ENST00000558394 NEUROD1Q13562 356 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPAN3-204ENST00000558394 IP6K1Q92551 441 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPAN3-204ENST00000558394 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPAN3-204ENST00000558394 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.31■■□□□ 1.64
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