RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 KLHL34Q8N239 644 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 ARXQ96QS3 562 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 MTFR1LQ9H019 292 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 CHD4Q14839 1912 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 GPR162Q16538 588 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 NLRP13Q86W25 1043 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 SOX12O15370 315 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 ZNF827Q17R98 1081 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 CEP350Q5VT06 3117 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 CABP2Q9NPB3 220 aa20.1■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 NLRP6P59044 892 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-231ENST00000552222 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 COL18A1P39060 1754 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 KCNQ4P56696 695 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 AKAP12Q02952 1782 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 CABP1Q9NZU7 370 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.85e-10■□□□□ 9.3
CS-231ENST00000552222 RGPD5Q99666 1765 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-231ENST00000552222 SLIT3O75094 1523 aa20.02■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 BCL9O00512 1426 aa20.02■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 EXOC5O00471 708 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 PAPPAQ13219 1627 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 MAP3K5Q99683 1374 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 CARD10Q9BWT7 1032 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 USP6P35125 1406 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 PIK3C2AO00443 1686 aa19.97■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CS-231ENST00000552222 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 AKT1S1Q96B36 256 aa19.95■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.95■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 NHSQ6T4R5 1651 aa19.94■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 TNS2Q63HR2 1409 aa19.93■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 ATP10DQ9P241 1426 aa19.93■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 BTAF1O14981 1849 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-231ENST00000552222 POLD1P28340 1107 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 MSL1Q68DK7 614 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 CCDC7Q96M83 1385 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 HSPA6P17066 643 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 NFAT5O94916 1531 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 ABCC6O95255 1503 aa19.83■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CS-231ENST00000552222 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 MSH5O43196 834 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 IL2RBP14784 551 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.81■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.8■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 STAC3Q96MF2 364 aa19.8■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 ERBB3P21860 1342 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 GRIN3BO60391 1043 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 SMIM5Q71RC9 77 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 NME9Q86XW9 330 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-231ENST00000552222 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 ADCY9O60503 1353 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 NSD2O96028 1365 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.74■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 KIF3CO14782 793 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 CAPN15O75808 1086 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 AMIGO3Q86WK7 504 aa19.72■□□□□ 0.75
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