RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 TXNRD1Q16881 649 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 STK32BQ9NY57 414 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 COL18A1P39060 1754 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 MTFR1LQ9H019 292 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 ARXQ96QS3 562 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 BCL9O00512 1426 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 PAPPAQ13219 1627 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 RGPD5Q99666 1765 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 NLRP13Q86W25 1043 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 SLIT3O75094 1523 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 MAP3K5Q99683 1374 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-230ENST00000551968 GPR162Q16538 588 aa20.2■□□□□ 0.82
CS-230ENST00000551968 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-230ENST00000551968 NHSQ6T4R5 1651 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-230ENST00000551968 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-230ENST00000551968 ZNF827Q17R98 1081 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-230ENST00000551968 PIK3C2AO00443 1686 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-230ENST00000551968 NLRP6P59044 892 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-230ENST00000551968 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 KLHL34Q8N239 644 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 BTAF1O14981 1849 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 CABP2Q9NPB3 220 aa20.13■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 USP6P35125 1406 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 TNS2Q63HR2 1409 aa20.1■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.1■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 EXOC5O00471 708 aa20.1■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 SOX12O15370 315 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.815e-10■□□□□ 9.3
CS-230ENST00000551968 CABP1Q9NZU7 370 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-230ENST00000551968 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 AKT1S1Q96B36 256 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 ABCC6O95255 1503 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 ATP10DQ9P241 1426 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 NFAT5O94916 1531 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 KCNQ4P56696 695 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 STAC3Q96MF2 364 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 CCDC7Q96M83 1385 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-230ENST00000551968 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-230ENST00000551968 POLD1P28340 1107 aa20■□□□□ 0.79
CS-230ENST00000551968 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-230ENST00000551968 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-230ENST00000551968 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CS-230ENST00000551968 HSPA6P17066 643 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-230ENST00000551968 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.96■□□□□ 0.79
CS-230ENST00000551968 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 GRIN3BO60391 1043 aa19.94■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 ADCY9O60503 1353 aa19.94■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 IL2RBP14784 551 aa19.93■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.93■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.93■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 ERBB3P21860 1342 aa19.93■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 LY75O60449 1722 aa19.93■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 LTN1O94822 1766 aa19.92■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-230ENST00000551968 MSL1Q68DK7 614 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 NSD2O96028 1365 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 USP54Q70EL1 1684 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 MSH5O43196 834 aa19.84■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 KIF3CO14782 793 aa19.83■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.83■□□□□ 0.77
CS-230ENST00000551968 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 EVC2Q86UK5 1308 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms