RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
CS-222	ENST00000550996	CDCA8	Q53HL2	280 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CS-222	ENST00000550996	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CS-222	ENST00000550996	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	29.14	■■■□□ 2.26
CS-222	ENST00000550996	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		29.14	■■■□□ 2.26
CS-222	ENST00000550996	CRB1	P82279	1406 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	MYOM1	P52179	1685 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	FAM182B	Q5T319	152 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	ABCC6	O95255	1503 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
CS-222	ENST00000550996	FYB1	O15117	783 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	CCDC125	Q86Z20	511 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	FBLN1	P23142	703 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	COG3	Q96JB2	828 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	LTN1	O94822	1766 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CS-222	ENST00000550996	ERBB3	P21860	1342 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	DISP2	A7MBM2	1401 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	IP6K1	Q92551	441 aa		28.97	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	PDE3B	Q13370	1112 aa		28.96	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		28.96	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	LRRC37A3	O60309	1634 aa		28.95	■■■□□ 2.23
CS-222	ENST00000550996	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	CCDC7	Q96M83	1385 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	HOXC9	P31274	260 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	DDB1	Q16531	1140 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	TRIM37	O94972	964 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
CS-222	ENST00000550996	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	AMPH	P49418	695 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	PANK3	Q9H999	370 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	RTL1	A6NKG5	1358 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	PEAK1	Q9H792	1746 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	BAG6	P46379	1132 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CS-222	ENST00000550996	TNS2	Q63HR2	1409 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	IL2RB	P14784	551 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	EXOC5	O00471	708 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	INSR	P06213	1382 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	FLT4	P35916	1363 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	BCL9	O00512	1426 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.76	■■■□□ 2.2
CS-222	ENST00000550996	APBA3	O96018	575 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	NBPF4	Q96M43	638 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	MEGF6	O75095	1541 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CS-222	ENST00000550996	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	SBF2	Q86WG5	1849 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	NSD2	O96028	1365 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	KCNQ2	O43526	872 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CS-222	ENST00000550996	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CS-222	ENST00000550996	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CS-222	ENST00000550996	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CS-222	ENST00000550996	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CS-222	ENST00000550996	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CS-222	ENST00000550996	RREB1	Q92766	1687 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CS-222	ENST00000550996	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CS-222	ENST00000550996	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.61	■■■□□ 2.17

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