RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-204ENST00000544999 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-204ENST00000544999 SOX12O15370 315 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 CDCA8Q53HL2 280 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 ABCC6O95255 1503 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 CRB1P82279 1406 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 RGPD5Q99666 1765 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD8-204ENST00000544999 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.65■■□□□ 1.38
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HOXD8-204ENST00000544999 EP400Q96L91 3159 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 LTN1O94822 1766 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 FAM182BQ5T319 152 aa23.61■■□□□ 1.37
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HOXD8-204ENST00000544999 PDE3BQ13370 1112 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 MYOM1P52179 1685 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 COG3Q96JB2 828 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD8-204ENST00000544999 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
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HOXD8-204ENST00000544999 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.58■■□□□ 1.37
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HOXD8-204ENST00000544999 LRRC37A3O60309 1634 aa23.55■■□□□ 1.36
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HOXD8-204ENST00000544999 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-204ENST00000544999 DISP2A7MBM2 1401 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-204ENST00000544999 DDB1Q16531 1140 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD8-204ENST00000544999 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 IP6K1Q92551 441 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM37O94972 964 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 PEAK1Q9H792 1746 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD8-204ENST00000544999 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.47■■□□□ 1.35
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HOXD8-204ENST00000544999 RTL1A6NKG5 1358 aa23.45■■□□□ 1.34
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HOXD8-204ENST00000544999 HOXC9P31274 260 aa23.45■■□□□ 1.34
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HOXD8-204ENST00000544999 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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HOXD8-204ENST00000544999 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD8-204ENST00000544999 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD8-204ENST00000544999 FLT4P35916 1363 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD8-204ENST00000544999 RREB1Q92766 1687 aa23.35■■□□□ 1.33
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HOXD8-204ENST00000544999 PANK3Q9H999 370 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD8-204ENST00000544999 INSRP06213 1382 aa23.34■■□□□ 1.33
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HOXD8-204ENST00000544999 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD8-204ENST00000544999 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.31■■□□□ 1.32
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HOXD8-204ENST00000544999 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF4Q96M43 638 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 NHSQ6T4R5 1651 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 NSD2O96028 1365 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-204ENST00000544999 MEGF6O75095 1541 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF14Q5TI25 921 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD8-204ENST00000544999 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.24■■□□□ 1.31
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