RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.42■■■□□ 2.46
PUS1-211ENST00000544662 RGPD5Q99666 1765 aa30.41■■■□□ 2.46
PUS1-211ENST00000544662 USP35Q9P2H5 1018 aa30.41■■■□□ 2.46
PUS1-211ENST00000544662 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.39■■■□□ 2.46
PUS1-211ENST00000544662 LTN1O94822 1766 aa30.38■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 COG3Q96JB2 828 aa30.37■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.37■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 CRB1P82279 1406 aa30.37■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 ABCC6O95255 1503 aa30.37■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.36■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 BARGINQ6ZT62 677 aa30.35■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.34■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.33■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.33■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 FYB1O15117 783 aa30.33■■■□□ 2.45
PUS1-211ENST00000544662 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.32■■■□□ 2.44
PUS1-211ENST00000544662 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PUS1-211ENST00000544662 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.31■■■□□ 2.44
PUS1-211ENST00000544662 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.3■■■□□ 2.44
PUS1-211ENST00000544662 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.29■■■□□ 2.44
PUS1-211ENST00000544662 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PUS1-211ENST00000544662 CCDC125Q86Z20 511 aa30.27■■■□□ 2.44
PUS1-211ENST00000544662 FBLN1P23142 703 aa30.25■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 FAM182BQ5T319 152 aa30.25■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.24■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.23■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.22■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 IP6K1Q92551 441 aa30.22■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 ERBB3P21860 1342 aa30.22■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 PDE3BQ13370 1112 aa30.2■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.2■■■□□ 2.43
PUS1-211ENST00000544662 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.19■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 PANK3Q9H999 370 aa30.18■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 LRRC37A3O60309 1634 aa30.18■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 EP400Q96L91 3159 aa30.17■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 CCDC7Q96M83 1385 aa30.17■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 AMPHP49418 695 aa30.17■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.17■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 HOXC9P31274 260 aa30.16■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.15■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 DISP2A7MBM2 1401 aa30.14■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 FAM196AQ6ZSG2 479 aa30.14■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PUS1-211ENST00000544662 RTL1A6NKG5 1358 aa30.14■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 DDB1Q16531 1140 aa30.13■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.13■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.1■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.1■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 PEAK1Q9H792 1746 aa30.1■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PUS1-211ENST00000544662 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.06■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 TRIM37O94972 964 aa30.06■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.05■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 FLT4P35916 1363 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 EXOC5O00471 708 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 IL2RBP14784 551 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 BAG6P46379 1132 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 INSRP06213 1382 aa30.03■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.02■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 TNS2Q63HR2 1409 aa30.02■■■□□ 2.4
PUS1-211ENST00000544662 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.01■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 NSD2O96028 1365 aa30.01■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 SBF2Q86WG5 1849 aa29.99■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.98■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 NBPF4Q96M43 638 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 POLKQ9UBT6 870 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-211ENST00000544662 APBA3O96018 575 aa29.94■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 BCL9O00512 1426 aa29.94■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.93■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 MORC1Q86VD1 984 aa29.92■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 MEGF6O75095 1541 aa29.9■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.89■■■□□ 2.38
PUS1-211ENST00000544662 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PUS1-211ENST00000544662 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.86■■■□□ 2.37
PUS1-211ENST00000544662 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PUS1-211ENST00000544662 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.84■■■□□ 2.37
PUS1-211ENST00000544662 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.84■■■□□ 2.37
PUS1-211ENST00000544662 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.84■■■□□ 2.37
PUS1-211ENST00000544662 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
PUS1-211ENST00000544662 NHSQ6T4R5 1651 aa29.82■■■□□ 2.36
PUS1-211ENST00000544662 RREB1Q92766 1687 aa29.82■■■□□ 2.36
PUS1-211ENST00000544662 NCAPD2Q15021 1401 aa29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms