RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.57■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 INSRP06213 1382 aa34.57■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 HOXC9P31274 260 aa34.56■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 ADAMTS2O95450 1211 aa34.55■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 COL18A1P39060 1754 aa34.54■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 CCER2I3L3R5 266 aa34.53■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 FAM83GA6ND36 823 aa34.52■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 PEAK1Q9H792 1746 aa34.52■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
STIP1-208ENST00000540501 CHRNA2Q15822 529 aa34.5■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 LRP6O75581 1613 aa34.5■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 MIER1Q8N108 512 aa34.49■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.49■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.47■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.46■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 RGPD5Q99666 1765 aa34.45■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 NGLY1Q96IV0 654 aa34.45■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 NUDCQ9Y266 331 aa34.45■■■■□ 3.11
STIP1-208ENST00000540501 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.44■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 C8orf37Q96NL8 207 aa34.43■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.42■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.42■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 MRS2Q9HD23 443 aa34.42■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 BTG4Q9NY30 223 aa34.42■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 SLIT2O94813 1529 aa34.41■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 EVA1CP58658 441 aa34.41■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 ERBB3P21860 1342 aa34.4■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.4■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
STIP1-208ENST00000540501 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.37■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 IL13P35225 146 aa34.37■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.35■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.34■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 NRAPQ86VF7 1730 aa34.33■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
STIP1-208ENST00000540501 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP34.31■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 STRN4Q9NRL3 753 aa34.31■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 USP21Q9UK80 565 aa34.31■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 CCDC184Q52MB2 194 aa34.3■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 AFF2P51816 1311 aa34.3■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.29■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 CRB1P82279 1406 aa34.28■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.27■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 EYA1Q99502 592 aa34.27■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.27■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.27■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.26■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
STIP1-208ENST00000540501 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.25■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.24■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 VPS72Q15906 364 aa34.24■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.23■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 NBPF4Q96M43 638 aa34.23■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.23■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 NCAPD2Q15021 1401 aa34.21■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 FCHSD2O94868 740 aa34.2■■■■□ 3.07
STIP1-208ENST00000540501 KDRP35968 1356 aa34.19■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.18■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.17■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.17■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa34.17■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.16■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 ATRNO75882 1429 aa34.15■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 NEFMP07197 916 aa34.15■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.15■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 ADAMTS8Q9UP79 889 aa34.14■■■■□ 3.06
STIP1-208ENST00000540501 FAM9BQ8IZU0 186 aa34.13■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.13■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 HMOX1P09601 288 aa34.12■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.11■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 POTEAQ6S8J7 498 aa34.1■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 BARGINQ6ZT62 677 aa34.1■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 RSPH6AQ9H0K4 717 aa34.1■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 USP35Q9P2H5 1018 aa34.09■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 IL2RBP14784 551 aa34.08■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.08■■■■□ 3.05
STIP1-208ENST00000540501 PRKAR2BP31323 418 aa34.06■■■■□ 3.04
STIP1-208ENST00000540501 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
STIP1-208ENST00000540501 RUNDC1Q96C34 613 aa34.05■■■■□ 3.04
STIP1-208ENST00000540501 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms