RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534499.1

RAB30-AS1-208, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RAB30-AS1, Length 597 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SMAPO00193 183 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GPR37L1O60883 481 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RGS22Q8NE09 1264 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CEP162Q5TB80 1403 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 STRCQ7RTU9 1775 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TIAM1Q13009 1591 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ATP7AQ04656 1500 aa14.71□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MTMR2Q13614 643 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.69□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KCNA1Q09470 495 aa14.69□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.69□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PLXNC1O60486 1568 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 BRD1O95696 1058 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RFX1P22670 979 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PROX2Q3B8N5 592 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GUCA2AQ02747 115 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 VAC14Q08AM6 782 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 A2MP01023 1474 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ALG2Q9H553 416 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SLC10A3P09131 477 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MBD5Q9P267 1494 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZMYM3Q14202 1370 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HLA-CQ95604 372 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MROH2AA6NES4 1674 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GGT6Q6P531 493 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MTMR7Q9Y216 660 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NCOA1Q15788 1441 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SOX11P35716 441 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TSC1Q92574 1164 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NCOA2Q15596 1464 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NPATQ14207 1427 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CFAP99D6REC4 459 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 POTEJP0CG39 1038 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KCNK17Q96T54 332 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PTPRTO14522 1441 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PTPRKQ15262 1439 aa14.58□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-208ENST00000534499 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.57□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 C6orf229H3BNL8 230 aa14.57□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 UCN2Q96RP3 112 aa14.57□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.56□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.56□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SLC4A3P48751 1232 aa14.55□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SLF2Q8IX21 1173 aa14.55□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PRR7Q8TB68 274 aa14.55□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.55□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ATG7O95352 703 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 FUT2Q10981 343 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.52□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KIF3BO15066 747 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SEMA3FQ13275 785 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PNMA1Q8ND90 353 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PLA2R1Q13018 1463 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SNPHO15079 494 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ATP6V1AP38606 617 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NR6A1Q15406 480 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms