RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 CRB1P82279 1406 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 SOX12O15370 315 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 USP35Q9P2H5 1018 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.24■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.23■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.23■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 COL18A1P39060 1754 aa23.22■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.21■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.21■■□□□ 1.31
PKP3-209ENST00000533069 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PKP3-209ENST00000533069 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
PKP3-209ENST00000533069 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.19■■□□□ 1.3
PKP3-209ENST00000533069 COG3Q96JB2 828 aa23.17■■□□□ 1.3
PKP3-209ENST00000533069 PDE3BQ13370 1112 aa23.16■■□□□ 1.3
PKP3-209ENST00000533069 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.15■■□□□ 1.3
PKP3-209ENST00000533069 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.14■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.14■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 FAM182BQ5T319 152 aa23.12■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 CCDC7Q96M83 1385 aa23.12■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 ERBB3P21860 1342 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 MYOM1P52179 1685 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 FYB1O15117 783 aa23.1■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 BAG6P46379 1132 aa23.1■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 DDB1Q16531 1140 aa23.08■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.08■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 LTN1O94822 1766 aa23.08■■□□□ 1.29
PKP3-209ENST00000533069 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.08■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 IP6K1Q92551 441 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 DISP2A7MBM2 1401 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.06■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 LRRC37A3O60309 1634 aa23.06■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.06■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 RTL1A6NKG5 1358 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 RGPD5Q99666 1765 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.03■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 TRIM37O94972 964 aa23.03■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 AMPHP49418 695 aa23.03■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.03■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.02■■□□□ 1.28
PKP3-209ENST00000533069 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.01■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 HOXC9P31274 260 aa23.01■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 TNS2Q63HR2 1409 aa22.99■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 EXOC5O00471 708 aa22.99■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.99■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.99■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 BCL9O00512 1426 aa22.99■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 IL2RBP14784 551 aa22.98■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 FBLN1P23142 703 aa22.98■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 PEAK1Q9H792 1746 aa22.98■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 APBA3O96018 575 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PKP3-209ENST00000533069 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 FLT4P35916 1363 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 INSRP06213 1382 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 PANK3Q9H999 370 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 NSD2O96028 1365 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP3-209ENST00000533069 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 PLSCR1O15162 318 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 NBPF4Q96M43 638 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.84■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.83■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.83■■□□□ 1.25
PKP3-209ENST00000533069 RREB1Q92766 1687 aa22.83■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.83■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 MEGF6O75095 1541 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 POLKQ9UBT6 870 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 SBF2Q86WG5 1849 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.81■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.8■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 NHSQ6T4R5 1651 aa22.8■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 NBPF14Q5TI25 921 aa22.79■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.79■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PKP3-209ENST00000533069 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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