RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532389.5

SERGEF-220, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-220ENST00000532389 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.52■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.52■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.51■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 TESK2Q96S53 571 aa29.51■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 DISP2A7MBM2 1401 aa29.51■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 COL18A1P39060 1754 aa29.5■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 NME9Q86XW9 330 aa29.5■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.49■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 APBA3O96018 575 aa29.48■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 DDB1Q16531 1140 aa29.48■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 NFAT5O94916 1531 aa29.48■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 A0A1W2PP64 1363 aa29.48■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.47■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.46■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 ABCC6O95255 1503 aa29.46■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 TMF1P82094 1093 aa29.46■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.46■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.45■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 USP47Q96K76 1375 aa29.45■■■□□ 2.31
SERGEF-220ENST00000532389 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.43■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.43■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.43■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 USP54Q70EL1 1684 aa29.42■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 CCDC7Q96M83 1385 aa29.41■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 CDCA8Q53HL2 280 aa29.41■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.41■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 RGPD5Q99666 1765 aa29.39■■■□□ 2.3
SERGEF-220ENST00000532389 COG3Q96JB2 828 aa29.37■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.37■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 LRRC37A3O60309 1634 aa29.37■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 EXOC5O00471 708 aa29.36■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 ERBB3P21860 1342 aa29.35■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.35■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.34■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 NBPF14Q5TI25 921 aa29.33■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.33■■■□□ 2.29
SERGEF-220ENST00000532389 LTN1O94822 1766 aa29.32■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.32■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 IP6K1Q92551 441 aa29.29■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 PEAK1Q9H792 1746 aa29.28■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 IL2RBP14784 551 aa29.27■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 BCL9O00512 1426 aa29.27■■■□□ 2.28
SERGEF-220ENST00000532389 AMPHP49418 695 aa29.26■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 TNS2Q63HR2 1409 aa29.25■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 LRP5O75197 1615 aa29.24■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 PLSCR1O15162 318 aa29.24■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 RREB1Q92766 1687 aa29.22■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.21■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 SBF2Q86WG5 1849 aa29.21■■■□□ 2.27
SERGEF-220ENST00000532389 FYB1O15117 783 aa29.2■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.2■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.18■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 HOXC9P31274 260 aa29.18■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.16■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 RTL1A6NKG5 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.14■■■□□ 2.26
SERGEF-220ENST00000532389 FBLN1P23142 703 aa29.13■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.1■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.1■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.09■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 KCNQ2O43526 872 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-220ENST00000532389 TXNRD1Q16881 649 aa29.07■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.07■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.06■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 NHSQ6T4R5 1651 aa29.05■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 MYOM1P52179 1685 aa29.05■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.04■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 PROM2Q8N271 834 aa29.04■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 SPON1Q9HCB6 807 aa29.04■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 STK32BQ9NY57 414 aa29.04■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 FLT4P35916 1363 aa29.03■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.02■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.02■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 INSRP06213 1382 aa29.01■■■□□ 2.24
SERGEF-220ENST00000532389 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SERGEF-220ENST00000532389 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SERGEF-220ENST00000532389 NBPF6Q5VWK0 638 aa29■■■□□ 2.23
SERGEF-220ENST00000532389 NBPF4Q96M43 638 aa29■■■□□ 2.23
SERGEF-220ENST00000532389 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SERGEF-220ENST00000532389 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.99■■■□□ 2.23
SERGEF-220ENST00000532389 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms