RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCC6O95255 1503 aa33.33■■■□□ 2.93
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 USP54Q70EL1 1684 aa33.32■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NFAT5O94916 1531 aa33.32■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COL18A1P39060 1754 aa33.32■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR17Q8IZU2 1322 aa33.31■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RGPD1P0DJD0 1748 aa33.31■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SOX12O15370 315 aa33.31■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa33.31■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMF1P82094 1093 aa33.3■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM182BQ5T319 152 aa33.3■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NME9Q86XW9 330 aa33.29■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.28■■■□□ 2.92
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CDCA8Q53HL2 280 aa33.26■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DISP2A7MBM2 1401 aa33.26■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.23■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CARD10Q9BWT7 1032 aa33.21■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.21■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa33.2■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.2■■■□□ 2.91
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRIM37O94972 964 aa33.18■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDB1Q16531 1140 aa33.18■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC7Q96M83 1385 aa33.17■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa33.15■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.15■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COG3Q96JB2 828 aa33.14■■■□□ 2.9
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RGPD5Q99666 1765 aa33.13■■■□□ 2.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LRRC37A3O60309 1634 aa33.13■■■□□ 2.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ERBB3P21860 1342 aa33.12■■■□□ 2.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 APBA3O96018 575 aa33.11■■■□□ 2.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WNK3Q9BYP7 1800 aa33.11■■■□□ 2.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LTN1O94822 1766 aa33.1■■■□□ 2.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.07■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EXOC5O00471 708 aa33.05■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.05■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.05■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BCL9O00512 1426 aa33.04■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IP6K1Q92551 441 aa33.04■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PEAK1Q9H792 1746 aa33.04■■■□□ 2.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TNS2Q63HR2 1409 aa33■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FYB1O15117 783 aa32.99■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IL2RBP14784 551 aa32.98■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAP3K19Q56UN5 1328 aa32.98■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AMPHP49418 695 aa32.97■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RTL1A6NKG5 1358 aa32.96■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.95■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.95■■■□□ 2.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HOXC9P31274 260 aa32.94■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYOM1P52179 1685 aa32.93■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RREB1Q92766 1687 aa32.93■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PLSCR1O15162 318 aa32.92■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NBPF14Q5TI25 921 aa32.92■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SBF2Q86WG5 1849 aa32.91■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa32.9■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.89■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.89■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LRP5O75197 1615 aa32.88■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF24Q5T7B8 1368 aa32.87■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.87■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.85■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FBLN1P23142 703 aa32.84■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.83■■■□□ 2.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FLT4P35916 1363 aa32.81■■■□□ 2.84
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 POLR3GLQ9BT43 218 aa32.8■■■□□ 2.84
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 INSRP06213 1382 aa32.79■■■□□ 2.84
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PTF1AQ7RTS3 328 aa32.78■■■□□ 2.84
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NHSQ6T4R5 1651 aa32.76■■■□□ 2.84
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCNQ2O43526 872 aa32.72■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ACSBG1Q96GR2 724 aa32.72■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa32.71■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NBPF6Q5VWK0 638 aa32.71■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NBPF4Q96M43 638 aa32.71■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TXNRD1Q16881 649 aa32.7■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa32.7■■■□□ 2.83
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PROM2Q8N271 834 aa32.68■■■□□ 2.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MEGF6O75095 1541 aa32.67■■■□□ 2.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa32.67■■■□□ 2.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RGPD2P0DJD1 1756 aa32.65■■■□□ 2.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TATP17735 454 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NSD2O96028 1365 aa32.64■■■□□ 2.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PANK3Q9H999 370 aa32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms