RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529505.1

SMIM19-208, Transcript of small integral membrane protein 19, human

TSL 3

Gene SMIM19, Length 920 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMIM19-208	ENST00000529505	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SMIM19-208	ENST00000529505	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SMIM19-208	ENST00000529505	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SMIM19-208	ENST00000529505	CRB1	P82279	1406 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SMIM19-208	ENST00000529505	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SMIM19-208	ENST00000529505		A0A1W2PP64	1363 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	PDE3B	Q13370	1112 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	LRP5	O75197	1615 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	TRIM37	O94972	964 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	29.16	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	NFAT5	O94916	1531 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	USP31	Q70CQ4	1352 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	USP54	Q70EL1	1684 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SMIM19-208	ENST00000529505	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	LRRC37A3	O60309	1634 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	PEAK1	Q9H792	1746 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	NME9	Q86XW9	330 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	ABCC6	O95255	1503 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	RREB1	Q92766	1687 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	APBA3	O96018	575 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SMIM19-208	ENST00000529505	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	SOX12	O15370	315 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	SBF2	Q86WG5	1849 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	FYB1	O15117	783 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SMIM19-208	ENST00000529505	DDB1	Q16531	1140 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	COG3	Q96JB2	828 aa		29	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	BCL9	O00512	1426 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	LTN1	O94822	1766 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	CCDC7	Q96M83	1385 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	MYOM1	P52179	1685 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.95	■■■□□ 2.23
SMIM19-208	ENST00000529505	PANK3	Q9H999	370 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	ERBB3	P21860	1342 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	TNS2	Q63HR2	1409 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SMIM19-208	ENST00000529505	PLSCR1	O15162	318 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SMIM19-208	ENST00000529505	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SMIM19-208	ENST00000529505	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SMIM19-208	ENST00000529505	NBPF14	Q5TI25	921 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SMIM19-208	ENST00000529505	EXOC5	O00471	708 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SMIM19-208	ENST00000529505	IP6K1	Q92551	441 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SMIM19-208	ENST00000529505	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SMIM19-208	ENST00000529505	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	FBLN1	P23142	703 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	NHS	Q6T4R5	1651 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	IL2RB	P14784	551 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	AMPH	P49418	695 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	PROM2	Q8N271	834 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	NSD2	O96028	1365 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.76	■■■□□ 2.2
SMIM19-208	ENST00000529505	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	HOXC9	P31274	260 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	RTL1	A6NKG5	1358 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	KCNQ2	O43526	872 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SMIM19-208	ENST00000529505	TXNRD1	Q16881	649 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SMIM19-208	ENST00000529505	SPON1	Q9HCB6	807 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SMIM19-208	ENST00000529505	BTAF1	O14981	1849 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SMIM19-208	ENST00000529505	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SMIM19-208	ENST00000529505	FLT4	P35916	1363 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SMIM19-208	ENST00000529505	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SMIM19-208	ENST00000529505	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SMIM19-208	ENST00000529505	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.66	■■■□□ 2.18

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