RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 AKAP12Q02952 1782 aa22.95■■□□□ 1.26
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TSTA3-206ENST00000527549 DDB1Q16531 1140 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-206ENST00000527549 ABTB2Q8N961 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-206ENST00000527549 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-206ENST00000527549 TXNRD1Q16881 649 aa22.92■■□□□ 1.26
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TSTA3-206ENST00000527549 STK32BQ9NY57 414 aa22.91■■□□□ 1.26
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TSTA3-206ENST00000527549 GPR162Q16538 588 aa22.77■■□□□ 1.24
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TSTA3-206ENST00000527549 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.77■■□□□ 1.24
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TSTA3-206ENST00000527549 NLRP6P59044 892 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.72■■□□□ 1.23
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TSTA3-206ENST00000527549 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.68■■□□□ 1.22
TSTA3-206ENST00000527549 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.66■■□□□ 1.22
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TSTA3-206ENST00000527549 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.63■■□□□ 1.21
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TSTA3-206ENST00000527549 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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TSTA3-206ENST00000527549 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.54■■□□□ 1.2
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TSTA3-206ENST00000527549 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.44■■□□□ 1.18
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TSTA3-206ENST00000527549 KIF3CO14782 793 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-206ENST00000527549 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-206ENST00000527549 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-206ENST00000527549 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-206ENST00000527549 KCNQ4P56696 695 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-206ENST00000527549 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 APLP1P51693 650 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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