RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522091.1

CHTF8-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, human

TSL 2 BASIC

Gene CHTF8, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF8-208	ENST00000522091	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CHTF8-208	ENST00000522091	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.91	■■■□□ 2.7
CHTF8-208	ENST00000522091	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.91	■■■□□ 2.7
CHTF8-208	ENST00000522091	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CHTF8-208	ENST00000522091	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
CHTF8-208	ENST00000522091	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CHTF8-208	ENST00000522091	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.88	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.88	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	RREB1	Q92766	1687 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	DDB1	Q16531	1140 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	NME9	Q86XW9	330 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CHTF8-208	ENST00000522091	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.82	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	ABCC6	O95255	1503 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091		A0A1W2PP64	1363 aa		31.78	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	TESK2	Q96S53	571 aa		31.77	■■■□□ 2.68
CHTF8-208	ENST00000522091	LTN1	O94822	1766 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CHTF8-208	ENST00000522091	ERBB3	P21860	1342 aa		31.7	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	BCL9	O00512	1426 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	EXOC5	O00471	708 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	PLSCR1	O15162	318 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CHTF8-208	ENST00000522091	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CHTF8-208	ENST00000522091	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CHTF8-208	ENST00000522091	USP47	Q96K76	1375 aa		31.59	■■■□□ 2.65
CHTF8-208	ENST00000522091	IL2RB	P14784	551 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	PROM2	Q8N271	834 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.56	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	IP6K1	Q92551	441 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	COG3	Q96JB2	828 aa		31.54	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.54	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	KCNQ2	O43526	872 aa		31.53	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	TMF1	P82094	1093 aa		31.53	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.64
CHTF8-208	ENST00000522091	FBLN1	P23142	703 aa		31.51	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.5	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	HOXC9	P31274	260 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CHTF8-208	ENST00000522091	FYB1	O15117	783 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	AMPH	P49418	695 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	BTAF1	O14981	1849 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.39	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.39	■■■□□ 2.62
CHTF8-208	ENST00000522091	MYOM1	P52179	1685 aa		31.38	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.38	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.38	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.37	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.37	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.36	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.34	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.34	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	MEGF6	O75095	1541 aa		31.34	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.33	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.33	■■■□□ 2.61
CHTF8-208	ENST00000522091	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CHTF8-208	ENST00000522091	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.3	■■■□□ 2.6
CHTF8-208	ENST00000522091	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.3	■■■□□ 2.6
CHTF8-208	ENST00000522091	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
CHTF8-208	ENST00000522091	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		31.28	■■■□□ 2.6
CHTF8-208	ENST00000522091	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.28	■■■□□ 2.6
CHTF8-208	ENST00000522091	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.28	■■■□□ 2.6
CHTF8-208	ENST00000522091	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6

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