RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC01559Q495D7 138 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.53□□□□□ -1.84
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NR3C2P08235 984 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-162P-201ENST00000516228 GATA4P43694 442 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-162P-201ENST00000516228 DOC2BQ14184 412 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-162P-201ENST00000516228 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NKAPLQ5M9Q1 402 aa3.49□□□□□ -1.85
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RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.49□□□□□ -1.85
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RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF217Q8TC41 542 aa3.46□□□□□ -1.86
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NLRP7Q8WX94 980 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 KLRG1Q96E93 195 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 NACC1Q96RE7 527 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF114Q9Y508 228 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 APBA3O96018 575 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 IRAK1P51617 712 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 RELBQ01201 579 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 GUCA2AQ02747 115 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 NBPF14Q5TI25 921 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 LYPD8Q6UX82 237 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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