RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515393.5

MCTP1-218, Transcript of multiple C2 and transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MCTP1, Length 5,396 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1-218ENST00000515393 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.28■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.27■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 TXLNAP40222 546 aa22.27■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.27■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.27■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 RNF214Q8ND24 703 aa22.27■■□□□ 1.16
MCTP1-218ENST00000515393 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 ABCC5O15440 1437 aa22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CBFA2T2O43439 604 aa22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 STK38Q15208 465 aa22.26■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.25■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.25■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.24■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 ABTB2Q8N961 1025 aa22.24■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CFAP45Q9UL16 551 aa22.24■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 TNMDQ9H2S6 317 aa22.23■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 RAB11FIP3O75154 756 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CDKL5O76039 1030 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 SMC2O95347 1197 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CCDC27Q2M243 656 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CABP1Q9NZU7 370 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 FIBPO43427 364 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.22■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 PDILTQ8N807 584 aa22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 DCTN1Q14203 1278 aa22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MCTP1-218ENST00000515393 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 NESP48681 1621 aa22.19■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.19■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 EPS15P42566 896 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 CCDC184Q52MB2 194 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 CAGE1Q8TC20 777 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 SPG7Q9UQ90 795 aa22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.17■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 ESPNB1AK53 854 aa22.17■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.17■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 FOSBP53539 338 aa22.16■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 OFD1O75665 1012 aa22.16■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.16■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.15■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 SMTNL1A8MU46 457 aa22.15■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 STIM1Q13586 685 aa22.15■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.15■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 FBXW7Q969H0 707 aa22.15■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.15■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 WASF1Q92558 559 aa22.14■■□□□ 1.14
MCTP1-218ENST00000515393 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.14■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 IL16Q14005 1332 aa22.14■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 ERLIN1O75477 346 aa22.13■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 SPATA32Q96LK8 384 aa22.13■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 PDE4CQ08493 712 aa22.12■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.12■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.12■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.12■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 ARHGEF11O15085 1522 aa22.11■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 SERPINC1P01008 464 aa22.11■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.11■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.1■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 ME1P48163 572 aa22.1■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 NUP160Q12769 1436 aa22.1■■□□□ 1.13
MCTP1-218ENST00000515393 IQCEQ6IPM2 695 aa22.1■■□□□ 1.13
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