RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ADH1BP00325 375 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 THSD4Q6ZMP0 1018 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ZPR1O75312 459 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP7D1Q3KQU3 841 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB33Q86T24 672 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC24Q8N4L8 307 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 EML3Q32P44 896 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAF7Q6Q0C0 670 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 SLAIN2Q9P270 581 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKMY2Q8IV38 441 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF428Q96B54 188 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SSFA2P28290 1259 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 OGFOD1Q8N543 542 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 MTRQ99707 1265 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 NYAP1Q6ZVC0 841 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CLDN10P78369 228 aa13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 DPYDQ12882 1025 aa13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM50Q86XT4 487 aa13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A16Q9GZN6 736 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 DOLKQ9UPQ8 538 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 NOD1Q9Y239 953 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP1A2P50993 1020 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP2B4P23634 1241 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 ERFEQ4G0M1 354 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 BAP1Q92560 729 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 SWI5Q1ZZU3 235 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01559Q495D7 138 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 OXLD1Q5BKU9 147 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF516Q92618 1163 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1024Q9UPX6 916 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 AGERQ15109 404 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 TJAP1Q5JTD0 557 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXJ1Q92949 421 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 IL21Q9HBE4 155 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 DKK1O94907 266 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 C4orf48Q5BLP8 95 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 SIX5Q8N196 739 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF511Q8NB15 262 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2IP78347 998 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEMA6NI47 508 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 S1PR4O95977 384 aa13□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF20Q5VTR2 975 aa13□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 SERPINB4P48594 390 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 SOWAHDA6NJG2 315 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 SCNN1AP37088 669 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC13P55735 322 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 ESPNB1AK53 854 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPN5P54829 565 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF20Q3BBV1 942 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC102BQ68D86 513 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 E9PSI1 815 aa12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 PRMT3O60678 531 aa12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf216Q8TAB5 229 aa12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 SFI1A8K8P3 1242 aa12.94□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 PSME1Q06323 249 aa12.94□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 OCLNQ16625 522 aa12.94□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 SH3BP2P78314 561 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 SIRT1Q96EB6 747 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms